毛承儀退入CD後，呂豪由宜昌進攻重慶，卻因山路難行，蜀軍頑抗等因素，放棄進攻重慶，經常德南下奪取銅仁，繼而向西攻占遵義，與廣西洪承疇部共圍貴陽，再進取昆明，至此，滇黔二省便在排灣帝國管轄範圍，呂豪將重兵擺放宜昌與遵義兩處，將四川東南兩路封鎖，防止蜀軍竄出襲擾西南及兩湖地區。
毛承儀回到CD後，並未因此得到喘息，西安的大順王朝李自成，見排灣帝國軍鋒所至，囊括中原諸省，連毛承儀也被趕回老巢，李自成躊思當前局勢，判斷排灣軍下一個目標極為可能就是自己，以目前大順朝實力抵擋排灣軍，無異是以卵擊石，便降尊號為大順王向排灣軍請降，仲坤賢看完奏摺，便回覆李自成:爾等先後降蜀、降排灣，繼而複叛，如何可信？如今竊占西安一隅之地，便想稱孤道寡，我若準你所求，將置軍中隨我爭戰南北之將士於何地？今準賜漢中伯爵位，編為西北軍區第五軍，任少將軍長，受帝國陸軍總司令部及西北軍區吳三桂司令節製，如嫌官卑職小，大可進取CD以獲取功名，稱王封侯、裂土封疆，不然亦可領兵來取北京龍椅。
仲坤賢的詔書送到西安，李自成看完後，額心冒汗，眉宇深鎖，左右部將連忙詢問何故，李自成說道:仲坤賢連封王也不準，隻封了個漢中侯，所部編為西北軍區第五軍，要我受吳三桂節製。左右將領便勸李自成自立，李自成歎道:如果自立於西北，隨之而來的便是排灣軍壓境，屆時就算避過殺身之禍，也成階下囚，這短命皇帝不當也罷，如今看來，排灣帝國政治清明，薄役輕徭，百姓安居樂業，以非明、魏兩朝亂世，豈容得我們聚眾起義，就算官兵不剿，百姓也不會相從，我看這次隻得真降了，諸將一想，李自成分析確實有理，便不再勸進，明末撼動大明王朝的李闖王，如今隻是個頂著一個漢中侯空銜的少將軍長。
仲坤賢進入紫禁城後，遣散後宮嬪妃，而宮女及閹人，則依其意願留任或離宮返鄉，從此不再召募太監服侍，為使政令簽署便捷，隻保留內廷後三宮做為居所，其餘宮殿均做為帝國政府部會及海陸軍總司令部辦公地點，皇城警衛改由憲兵司令部接管，中華排灣大帝國政府則正式開始運轉，仲坤賢在早朝時告誡全體官員，要屏除官僚惡習，以服務人民為目的，並舉了朱元璋農民起義覆滅元朝的例子，人民就像水，水能載舟；亦能覆舟，而自他以下各級官員，並非是食君俸祿，而是由人民供養，所以民為國本；本固邦寧，就是這麽個道理。
仲坤賢推行的第一項政令是新生活運動，而內容中的第一條便是剃發令，未避免百姓反彈，此項政令隻針對文武官員及現役軍人適用，政令中說明為保留各族文化傳統及習俗僅鼓勵而不強迫，但文武官員則必須剪短，現役軍人則需留平頭，並說明短發好處，因此，百姓也廣為接受，甚至看到地方官員及軍人後，蔚為風尚，紛紛改留短發。其次則是強化國民健康，以勞動強身為榮；以奢侈鋪張為辱，以及五族共和觀念，強調人種及民族皆生而平等，設立民族參政會，針對各族群的問題進行討論與解決，並強化社會福利製度，如醫療、教育、輔導就業等，及殘疾、孤兒、老人等社福機構廣設全國，除了實現現代的人性關懷及國民福利外，最主要的好處則是杜絕了因天災、人禍間接產生的民變，讓李自成這類的英雄豪傑沒有著力點去鼓動革命。
仲坤賢又想到中國地大物博，卻因為明清兩朝鎖國，造成國家封閉，斷絕了世界同步的步伐，使中華文明在十八世紀後由領先的地位淪落到落後於西方列強，最終成為列強的次殖民地，任人宰割，讓中華民族承受了百年的傷痛，於是仲坤賢開放所有沿海口岸，鼓勵通商，並對各國收取關稅，增強國家經濟能力，減輕國民賦稅，也因此中國由明末的一億人口迅速成長，幾年後便已超過清朝中葉統計的四萬萬人口，大幅加強了國力與戰力。
而此時羅柏特也帶來了湯若望，仲坤賢與之相談甚歡，仲坤賢故意提出熱氣球的原理，並說此原理讓他有了研究與製造蒸汽機的構想，湯若望一聽也極感興趣，便允諾留下來擔任中央科學研究院副院長，院長則是中國明末清初的科學家方以智，羅柏特則擔任軍事科技研究院院長，兩院互為支援，將研究成果運用於民生及軍事上，而院士則挑選國內人才及高薪聘請各國科學家，這些政策讓中國成為當時世界科技大國，各國科學家也以能夠受聘於中國而感到光榮，而湯若望又新修訂了排灣新曆，時為西元一六三三年。
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