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北宋慶曆年間（1041—1048年），平民畢昇發明活字印刷術，改良了印刷典籍的技術，中華典籍的生產又一次發生重大革新。
畢昇發明的泥活字印刷，即用膠泥刻字，每字為一印，按照典籍內容排列，隨時替換，非常方便。
如此一來，印刷效率更快，這比德國人穀登堡用活字排印書籍早了四百年。直到清朝，畢昇的活字印刷術仍被廣泛采用。
宋末，北方的蒙元崛起，橫掃天下，後來參與製定元朝典章製度的漢人姚樞，在金朝做過一陣子小官後，棄官避禍，攜一家老小隱居於今河南輝縣。
在這個河南小城，姚樞除了開墾荒地，每日乾農活外，便是用畢昇發明的活字印刷排版印製《小學》這類書，傳之於民，造福四方。
後來，他被元朝起用，成為一代名臣。
姚樞不僅屢次勸說蒙古貴族停止屠戮，而且還對儒、道、釋、醫、卜等各類典籍進行收集、保護，使典籍不再毀於蒙古鐵騎的野蠻踐踏。
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蒙古軍隊攻下湖北德安後，俘虜了人稱“江漢先生”的學者趙複，姚樞前去勸勉一心求死的趙複，告訴他，隻有活下來，他的畢生所學才能傳諸後世。趙複雖不願跟隨姚樞北上，但相信姚樞的傳道之心，將所藏八千卷書全部托付給了姚樞。
正因為有了這些學者的守護，宋朝雖亡，文脈不絕。
明清時期，我國古代典籍發展達到極盛。永樂大帝朱棣為彰顯國威，命解縉、姚廣孝等千名學者、大臣網羅天下典籍，編成《永樂大典》，這是當時世界上最大的百科全書。可惜的是，該書大部分毀於火災和戰亂，隻有八百餘卷散落於世界各地，存留下來的不足原書的4%。
毀書最嚴重的王朝莫過於清。清朝的文字獄對典籍造成難以估量的損失。
在清初的明史案中，浙江湖州富戶莊廷購買了前朝朱國禎編纂的《明史》，並召集江浙一帶的名士對原稿進行增補，募集印刷匠刊印，以莊氏的名義出版發行。書中詳細記載了崇禎與南明隆武、永曆二帝的經曆，提及清軍入關的曆史，卻不用清帝年號。不久後，此書被人告發，清廷震怒。
當時莊廷已死，他的家人與參與印刷、賣書的人都被捕處死，就連一些曾經購書的人也不能幸免，前後有兩百多人死於非命。
除了《明史》案，康、雍、乾年間還有戴名世案、查嗣庭案、呂留良案等。據統計，康、雍、乾三代興起的文字獄有一百多樁，被毀典籍不計其數。
這一時期，隻言片語就可能招來禍害。有關明史的著作或者被清廷認為議論偏謬，有影射之嫌的著作都被一並禁毀，如高拱的《邊略》、張居正的《太嶽集》、葉向高的《四夷考》、顧炎武的《亭林集》、黃宗羲的《行朝錄》等都在焚毀之列，流傳下來的，也是十不存一。清廷的思想禁錮也在一定程度上導致了中國近代前夜的落後。
乾隆皇帝在位時，為了顯示自己的雄才大略，決定編一部龐大的《四庫全書》，涵蓋經史子集等各類典籍，還為收藏《四庫全書》修建了包括紫禁城文淵閣在內的南北七閣。
然而，乾隆命人編纂《四庫全書》，還打著自己的小算盤，他說：“明季末造野史甚多，其間毀譽任意，傳聞異辭，必有抵觸本朝之語，正當及此一番查辦，儘行銷毀，杜遏邪言，以正人心而厚風俗。”
編修《四庫全書》也包括禁書、毀書、焚書，銷毀不利於清朝統治的書。所以當乾隆帝頒發征求圖書諭旨時，民間藏書家不敢輕易獻書，因為文字獄給他們留下了深刻的心理陰影。
私人藏書成為文化迫害下的最後一片桃花源。
明清時期，江浙一帶為私家典籍收藏的主要區域。乾隆編修《四庫全書》後，為了修建防火、防潮、防蠹、能夠長期保存書籍的藏書樓，特意派人前往寧波了解範氏天一閣的構造。
天一閣建於明嘉靖年間，曆經四百年不毀，是我國現存最古老的藏書樓，第一任主人為退隱的明朝兵部右侍郎範欽。
範欽嗜書如命，不但在天一閣的建設上費儘心力，還嚴格管理樓中典籍，他的書不輕易借人，就算是親族也不外借。範欽怎麼也想不到，天一閣的建築可防止典籍受潮黴變，卻無法躲過亂世之劫。在明末、晚清、民國的多次戰亂中，天一閣的藏書先後被盜，到解放初期，範氏藏書僅餘七分之一。
除了天一閣等明代藏書樓，清代還有四大私人藏書樓分布於南北各地。在江浙一帶，江蘇常熟有瞿氏修建的鐵琴銅劍樓，浙江湖州有陸心源建的皕宋樓，杭州有丁氏修建的八千卷樓。
北方藏書樓則以楊以增修建的海源閣為代表。
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