路的遠近險夷等情況，無不了然於胸。
他早年所著的《龍飛紀略》，詳細地記載了南洋西洋各國的土產風物，並且鮮明地主張開放海禁，開展海外貿易，然而，該書出版之後，吳樸卻因所謂“妄言海禁”而被關進牢獄。
他在獄中憤然創作了不朽之作《渡海方程》，這本書全麵整理了鄭和下西洋的航海路線以及民間眾多遠洋航海手冊，為出海者提供了精準的航線指南和海圖，至今閩粵地區的海商仍廣泛持有其部分內容。
之所以說是部分內容，是因為全書分為‘理論’和‘圖表’兩大部分，為了節省成本，海商們通常隻保留了‘圖表’部分進行刊印，這便是後來廣為人知的《海道針經》。然而，由於大海商們的文化水平有限，這部作品被誤傳為《海盜真經》，並被視為遠洋航行的寶貴指南。
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但鮮為人知的是，被海商、海盜及船主們忽視的‘理論’部分，實際上蘊含了作者最為卓越的見解！
在‘戰略規劃篇’中，作者不僅呼籲朝廷放寬對民間航海活動的限製，還明確提出希望大明朝能像百年前鄭和下西洋那樣，組建艦隊巡航從東北鴨綠江口到西南波斯灣的廣闊海域，將佛郎機、奧斯曼等國的勢力驅逐出大明的領土！
他建議借鑒鄭和當年設立舊港宣慰司的做法，在這漫長海疆的關鍵節點上，建立多個都護府和市舶司，以加強管理和促進貿易往來。
鄭若曾提出“製海權”概念，強調交戰方對特定海域的掌控，而吳樸的見解則更具前瞻性，他主張的已不僅僅是戰時的海域控製，而是國家在海洋空間的全麵影響力，這堪稱早期的“海權”思想萌芽。
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