時刻，武後特意安排的監軍魏元忠開始發揮作用了。他馬上去找李孝逸談心，話頭話尾一直在暗示李孝逸：徐敬業打的是匡扶唐室的旗號，而您又是宗室親王，若您一直畏縮不前，難免讓人懷疑與徐敬業暗中勾結，萬一太後怪罪下來，到時您一定罪責難逃！
李孝逸嚇得冷汗直冒，隻好下令軍隊出擊。
朝廷軍的戰鬥力本來就在叛軍之上，一旦主帥下定進攻的決心，自然是勢如破竹、所向無敵。十月下旬，副總管馬敬臣在都梁山擊敗並斬殺了尉遲昭；十一月初，李孝逸大軍又先後擊敗叛軍將領韋超和徐敬猷。至此，徐敬業的左膀右臂被全部砍斷。朝廷軍乘勝而進，於十一月中旬在下阿溪與徐敬業主力展開了決戰。
下阿溪一戰，朝廷軍一開始頻頻受挫。先是前鋒蘇孝祥率五千人趁夜搶渡溪流，遭遇叛軍頑強阻擊，蘇孝祥戰死，官兵多半落水溺斃；繼而李孝逸主力又多次發動進攻，均被叛軍一一擊退。生性怯懦的李孝逸再次萌生退意，被魏元忠阻止。魏元忠仔細觀察了戰場上的風向之後，力勸李孝逸采用火攻之策。
李孝逸本人雖然怯懦無能，但卻善於聽取正確意見。冬天裡漫山遍野的枯草成全了官軍的火攻戰術，隻見數千艘燃燒著熊熊烈焰的草船順著呼嘯的北風迅速撲向駐守南岸的叛軍。火船撞上南岸之後，漫天大火開始在叛軍營帳瘋狂蔓延，頃刻間吞噬了徐敬業麾下的七千部眾，也一舉燒毀了徐敬業的所有夢想。
徐敬業在慘遭重創之後落荒而逃，跟隨他逃亡的隻有徐敬猷、駱賓王以及少數殘部。大多數部眾就算沒被燒死，也都成了官軍的刀下之鬼，或者沉入下阿溪喂魚去了。徐敬業倉皇敗退揚州之後，一刻也不敢耽擱，又匆忙帶上家眷逃奔潤州。
光宅元年十一月十八日，徐敬業一行逃至海陵（今江蘇泰州市），準備從這裡渡海流亡高麗。無奈老天爺總是和他作對，這一天又刮起猛烈的東北風，使他的船隻根本無法張帆出海。徐敬業望著濁浪翻湧的海麵，一種冰冷的絕望瞬間彌漫他的全身。那天夜裡，一個叫王那相的部將趁徐敬業熟睡之際，偷偷潛入他的帳中，輕而易舉地割下了他的首級，隨後又砍殺了徐敬猷和駱賓王，帶著三人的首級投降了官軍。數日後，叛軍餘黨唐之奇、魏思溫等人也相繼被捕，被官兵砍下首級，傳送神都。
至此，徐敬業叛亂宣告平定。
擁兵十萬的徐敬業從起兵到被殺，曆時僅兩個多月。其敗亡之速，其下場之不堪，讓許多大唐臣民在日後追憶的時候仍然唏噓不已。
徐敬業等人沾滿血汙的首級傳送洛陽後，被高高懸掛在端門前的旗杆上示眾。那天，盛裝華服的武後站在則天門樓上遠遠地望著，感覺那幾顆肮臟的首級就像是爛在枝頭上無人采摘的野果，隻等烏鴉和禿鷲前來啄食。武後那天自始至終沒有說一句話，然而細心的朝臣卻分明看見她的嘴角蕩漾著一抹矜持的笑容。
那天有狀若血火的淒美晚霞在西天灼灼燃燒，像極了下阿溪岸邊百年一遇的熊熊烈焰。武後起駕回宮的時候，隨行的文武百官束手站立在甬道兩側，看見武後端坐在禦輦上，從太初宮寬廣的殿庭中徐徐而過。在金黃色的餘暉映照之下，武後那張方額廣頤的臉龐似乎罩上了一層綺麗的光暈。
百官們斂首低眉，莫敢仰視。
他們都說，當時的武後看上去就像一尊凜然不可侵犯的神祇。
大清洗：裴炎之死
在徐敬業敗亡之前，帝國的一個重要人物已經先他而死。
這個人就是裴炎。
裴炎下獄後，武後親自點名，命左肅政大夫騫味道和侍禦史魚承曄負責審查，目標很明確，就是要不擇手段坐實裴炎的謀反罪名。
審訊過程中，裴炎語氣強硬，毫不妥協。有人勸他適當讓步，或者態度謙遜一點，以求避死免禍，可裴炎卻搖頭苦笑，說：“宰相一旦下獄，豈有活命的可能？”
。了亡死於懼無經已炎裴的刻此，說以可上本基
𝑤𝑡.𝑝𝑜𝑜問訪請，新更節章新最取獲
。死赴然坦後然，裂決開公後武與——是就那，了走以可路條一有隻己自道知就他，後心野和心決的代換朝改後武見看地疑無鑿確炎裴從
。宗高見去下地到麵臉有還碼起，節名的臣忠唐李個一住保能也碼起，死一快痛，戮就頸引如不還那，子輩半下過活地苟狗營蠅，憐乞尾搖下裙榴石的人婦老個這在者或，子賊臣亂的憤共神人個一成變，凶幫的唐李覆顛後武當充其與——確明很度態和場立的炎裴，夫大士家儒的典經賢聖讀熟，學就館文弘入進就小從個一為作。的醒清是還炎裴，上題問性則原的危安稷社、常綱臣君及涉個這在，刻時的後最個這在之總，求訴益利和的目治政的人個少多有藏還裡心炎裴管不也，易交治政的心於契默少多過有後武和去過他管不
。果結的擇選己自他是全完，步一這天今到走炎裴，以所
。責自和悔懊的初當必何日今知早種一有會就炎裴，點一這到想。勞功份一的炎裴有也疑無，下天唐李了篡的真果如後武來未，此因。的炎裴於功歸要是上度程大很在，性法合的下天臨母、製稱朝臨得獲，子兒個幾平擺利順夠能以所之後武，認否能不都誰！忙的多太後武了幫初當悔後他——是就那。亡死擇選動主炎裴使迫也因原要重個一有還，外之具工的唐篡後武為成願不了除
。脫解和贖救種一是說如不還，難災和罰懲種一是說其與，講來炎裴的刻此於對亡死，此因
）三〇二卷》鑒通治資《（”！反不其明敢臣，知所下天，上奉心悉，國於功有，臣元稷社，炎“：說後武對然公上堂朝在們他。屈叫冤鳴炎裴為力竭，首為範元胡）郎侍書中（郎侍閣鳳和先景劉）中侍（言納以派一另；反必炎裴稱堅，首為諶景李）人舍書中（人舍閣鳳和道味騫官審主以派一。派兩了成分速迅們官百武文，案反謀炎裴的決未而懸對麵。爭戰的煙烽有沒場一了響打也上廷朝的陽洛都神，時之燒燃熊熊州揚在火烽的變兵業敬徐當正
叛州揚
