溯自宣和元年正月改佛菩薩號，翌年九月複舊：中間不過年餘耳。
自宋興以迄於亡，除徽宗稍稍排佛外，累代俱保護佛教。宋時，遼起於蒙古；遼衰，金起於滿洲；此二國皆自北方，侵入我國本部。西則李元昊（西藏種之一，黨項人）據有河西之地，建西夏國，窺宋西陲。而宋之內部，前則有王安石、司馬光等新舊法之爭；後則有秦檜、嶽飛等和戰之訌；謀國之論，殊不一致。徽欽而後，國步益艱；終至遷都臨安。當是時，元太祖成吉思汗，鐵木真，蒙古人。勢頗強盛；自太宗（窩闊台）以至憲宗（蒙哥），領土日擴；東達朝鮮，西及小亞細亞一部；一軍服俄羅斯地，一軍進匈牙利，一軍侵入德意誌之西列西亞，奪我國揚子江以北之地，威力及西藏安南。至世祖忽必烈汗，全滅趙宋，一統華夏，國號曰元。
元世祖未即位前（即其兄憲宗時代），受命擊西藏，即尊信西藏佛教（即喇嘛教）；即位後，甚保護之；元代可謂為喇嘛教時代也。
元世祖至元十八年，謂道教書，皆後世偽造；除老子《道德經》而外，所有《道藏》，皆命燒棄；舉凡毀謗佛教、偷竊佛語、貪財利、誑惑百姓之類，悉禁止；並刻石立碑，載其始末。此舉實發端於憲宗之時，茲據《佛祖通載》述其次第於下：
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乙卯間憲宗之五年，宋尚存；當宋理宗寶祐三年，迄至元十八年，殆為三十年前之事。道士丘處機、李誌常等，毀西京天城夫子廟為文城觀；毀滅釋迦佛像、白玉觀音、舍利寶塔，謀占梵刹四百八十二所；傳襲王浮偽語，老子八十一化圖，惑亂臣佐。時少林裕（福裕）長老，率師德詣闕陳奏。焚毀《道藏經》之碑文，載有罽賓大師蘭麻、僧統福裕之名。先朝蒙哥皇帝（憲宗）玉音宣諭，登殿辯對化胡真偽，聖躬臨朝親證；李誌常等義墮詞屈，奉旨焚偽經；此時論議，帝師發思巴與道士難詰；焚偽經四十五部，亦見於碑文；罷道為僧者十七人；還佛寺三十七所；黨占餘寺，流弊益甚。丁巳秋（憲宗七年），少林裕長老複奏；續奉綸旨偽經再焚；僧複其業者二百三十七所。由乙卯而辛酉，凡九春（辛酉世祖即位之二年）；而其徒竄匿，未悛邪說；諂行屏處，猶妄驚瀆聖情；由是至元十八年冬，欽奉玉音，頒降天下，除《道德經》外，其餘說謊經文，儘行燒毀；道士愛佛經者為僧，不為僧者，娶妻為民。當是時，江南釋教都總統、永福楊大師璉真佳，大弘聖化。自至元二十二春，至二十四春凡三載，恢複佛寺三十餘所；如四聖觀者，昔孤山寺也。道士胡提點等，舍邪即正，罷道為僧者，奚啻七八百人雲雲。
由是觀之：此種爭執之大體可知矣。又焚棄道教偽經，憲宗之世，既已行之；其後尚實行數次；考其起因，實由於道教之徒，占領寺院，數侵佛教之範圍；如孤山寺者，有名之伽藍也，其時已化為道觀矣。當時之道教，有正一教、真大教、太乙教，三派之別：正一教起自張道陵；其餘二派，則始於金之道士：即真大教為劉德仁所唱；太乙教為蕭抱真所唱；此等道教，至是皆受極大之打擊。《辯偽錄》（五卷）載《焚毀諸路偽道藏經之碑》，乃至元二十一年祥邁奉世祖敕所撰，專為破斥道教而設也。蓋排佛之舉，雖複見於明世宗之世；然在我國曆史上觀之：此次可稱道佛二教爭執之最後時期矣。
《佛祖通載》列此焚毀之《道藏經》書目，凡三十九部。又《辯偽錄》載僧侶與道士論議者十七人，道士之歸佛者十七人，所謂十七僧者：即燕京圓福寺從超、奉福寺德亨、藥師院從倫、法寶寺圓胤、資聖寺至溫、大名府明津、薊州甘泉山本璉、上方寺道雲、灤州開覺寺祥邁、北京傳教寺了詢、大名府法華寺慶規、龍門縣行育、大都延壽寺道壽、仰山寺律主相叡、資福寺善朗、絳州唯識講主祖珪、蜀川講主元一是也。
元自世祖崩後，曆七十餘年而亡；蓋世祖時代，蒙古極臻隆盛；殆世祖崩，元遂式微。其間喇嘛教，頗蒙保護；因保護之甚，釀成弊害；至於佛教史上，則別無顯著之事跡。惟劉秉忠之曆史，有足述焉：蓋秉忠固助世祖立大功之人也。初蒙古都哈喇和林，世祖之時，移都燕京，建國號曰元；種種製度，多為秉忠所定。秉忠，本禪僧也；先是海雲禪師應世祖之召，途次雲中；聞秉忠博學多才，偕謁世祖，大合帝意；海雲南還，秉忠奉命留侍左右，決大事者三十餘年；官光祿大夫太保；死贈儀同三司太傅，封趙國公，諡文貞；秉忠雖位極人臣，尚齋居蔬食，終日淡然，無異平昔。
明太祖朱元璋，濠州人；少失兩親，入皇覺寺為僧。元末，各地豪傑並起，元璋亦起於濠州；隨郭子興，得其信任；終領其眾而大興；故即位後，頗保護佛教。不獨佛教為然，即道儒二教，亦加保護。當時鑒於元末佛教流弊，以為不嚴重約束佛子之行為，則不得望佛教之興隆，於是凡欲為僧者必考試經典，給度牒，不許任意出家；禁僧侶混雜俗人中生活，有帶妻者，加以嚴懲；而鼓勵避俗修禪山中者。於洪武二十七年，敕禮部榜示各條之中，一一舉之。其文曰：“凡僧之處於市者，務要三十人以上，聚成一寺。”又曰：“僧有妻者，許諸人捶辱之；更索取錢鈔，如無鈔者，打死勿論。”又出榜文，張掛天下各寺；凡輕慢佛教，罵詈僧侶者處罰。
又為處理僧侶寺院（道教亦然）計，詳定僧官之製；設僧道衙門，置僧錄司、道錄司，各任其官；品秩甚高，待遇優渥。大理寺卿李仕魯屢上疏陳僧侶之跋扈，不采；仕魯辭宮，帝怒而處之以死。茲將其時所設之僧官，舉之於下：大體依據宋製。
僧錄司，掌天下僧教事。（京師）
左善世（正六品）
右善世（正六品）
）品六從（教闡左
）品六從（教闡右
）品八正（經講左
）品八正（經講右
）品八從（義覺左
）品八從（義覺右
仲教闡右，輝智教闡左，泐宗世善右；資戒世善左有則，者命任之司錄僧受時此
