，隻得照辦。
在回京的路上，肅順等人曾試圖在古北口派侍衛兵將那拉氏刺死，誰料那拉氏早有防備，一路上戒備森嚴，刺客根本無從下手。
鹹豐十一年（1861）九月二十九日，西太後一行先肅順等人抵達北京。此時的奕䜣已在京城將一切都準備妥當，向幾位顧命大臣張開了鋪天大網。
那天早朝，文武百官向小皇帝朝拜請安之後，奕䜣突然站出來，讓侍衛將載垣、端華等人拿下，並宣讀了早就擬好的諭旨。諭旨中列出八大臣數條罪狀，條條款款，有依有據。事情來得太過突然，可憐幾位顧命大臣還沒反應過來，就被侍衛們一擁而上拿下了。
八大臣被解職，交宗人府定罪。
早被奕䜣籠絡好的文武百官，則趁機聯名上本，要求皇太後臨朝聽政。
那時，肅順還在返京的路上，才行至密雲境內。他對京城發生的一切還一無所知，直到西太後派去的人在密雲驛站將他捆綁起來。
鹹豐帝臨終重托的八位顧命大臣，瞬間就成了那拉氏的階下囚。為了最大限度地籠絡人心，對八大臣，那拉氏也有所區別地對待：將軍機處的景壽、穆蔭等五人革職，發配新疆效力贖罪；載垣、端華賜令自殺；肅順斬立決。
隨後，在太和殿，為新皇帝載淳舉行了即位儀式，廢除“祺祥”年號，改用“同治”年號（為兩位皇太後與小皇帝共同治理國家的意思）。同時，為兩位皇太後加徽號，東太後“慈安”，西太後“慈禧”。兩宮太後開始正式垂簾聽政。東太後不問政事，實際上是慈禧一人開始獨斷專行。
這一年是農曆辛酉年。這場宮廷政變遂被稱為“辛酉政變”。晚清從此開始了長達四十八年的慈禧統治時代。
據傳，清太祖努爾哈赤當年攻破葉赫部，葉赫臨死時對努爾哈赤稱：數年之後，吾葉赫族隻留存一女，也將滅你建州。又傳努爾哈赤曾掘出一古碑，上刻“滅建州者葉赫”六字。
彼時，太祖皇後是葉赫國公主，卻深得努爾哈赤喜愛，姻緣早已注定，也無力再行改變，但努爾哈赤卻告誡後世子孫，不得與葉赫氏聯姻。順治等皇帝皆遵祖訓，到鹹豐帝，因年久歲深，這條祖訓便被拋諸腦後。
載垣卻記得清晰，臨死前他恨道：“滅清朝者葉赫，此話要應驗了。”
野史傳說，不足為憑。後人據那拉氏所作所為而杜撰附會也未可知，但事實上，那拉氏確實是一步步將清朝引向了窮途末路。
在這場政變中，肅順是八大臣中的核心人物，也是受罰最重的一個——斬立決。
一直以來，肅順對曾國藩等漢族官員都非常重視，曾國藩後來的幾次升遷都得力於肅順的力薦。聽到這樣的消息，對曾國藩來說自是一份沉重的打擊。這場宮廷政變的消息直到兩個月後才傳到曾國藩的耳朵裡，當他通過一份私人信件了解到這場政變的詳情，不由扼腕長歎：“此冤獄也，自壞長城矣。”
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