義熙六年二月，晉軍攻破廣固城，慕容超被擒，南燕遂亡。
劉裕將慕容超押解至建康斬首，又清剿南燕殘餘勢力，淮北之地儘歸晉室。
義熙八年，西蜀譙縱趁晉廷內亂，僭號稱帝，割據益州，屢犯荊州。
劉裕遣朱齡石率大軍伐蜀，臨行前，劉裕密授朱齡石計策，命其大張旗鼓，佯攻成都，實則率主力取道內水，直搗譙縱老巢。
朱齡石依計而行，蜀軍果然中計，主力被牽製於外水。
晉軍主力則趁虛而入，攻克成都，譙縱走投無路，自縊而亡，西蜀平定，益州重回晉廷版圖。
義熙十二年，劉裕見後秦主姚興病逝，其子姚泓懦弱無能，國內宗室相殘，遂決意揮師北伐，收複關中故地。
是年八月，劉裕以世子劉義符監國，自率大軍兵分四路北伐後秦。
一路由王鎮惡、檀道濟率領，自淮、淝入許、洛，攻克許昌、洛陽；一路由沈田子率領，自襄陽入武關，牽製後秦兵力；劉裕則親率主力，自彭城經泗水、汴水，進至洛陽。
諸路大軍進展神速，後秦守軍望風而降。
義熙十三年，劉裕率主力進抵潼關，與王鎮惡會師。
姚泓調集全國兵力，屯於潼關之下，欲與晉軍決一死戰。
劉裕巧用計策，命王鎮惡率水軍自黃河入渭水，直搗長安；又命沈田子率輕騎襲擾後秦後方。
姚泓分兵抵禦，兵力分散。
王鎮惡率水軍突破渭水防線，直抵長安城下。
姚泓率軍出城迎戰，被王鎮惡擊敗，逃回城中。
晉軍乘勢攻城，長安守將開城投降。
姚泓束手就擒，後秦覆滅。
劉裕率軍進入長安，關中父老簞食壺漿以迎王師，哭曰：“不圖今日複見漢官威儀！”
劉裕下令安撫百姓，整頓吏治，關中之地民心歸附。
若乘勢北進，收複故土亦非難事。
然就在此時，留守建康的劉穆之猝然病逝。
劉穆之乃劉裕心腹，總攬朝政，一旦離世，朝局恐生變故。
劉裕深知“根基在江左，不可久留關中”，遂決意東歸。
臨行前，劉裕命其子劉義真為安西將軍，鎮守長安；又命王鎮惡、沈田子等人輔佐。
然劉義真年少無謀，諸將又互相猜忌，矛盾叢生。
劉裕東歸之後，夏主赫連勃勃趁機率軍南下，攻打長安。
沈田子忌恨王鎮惡之功，竟誣其謀反，將其斬殺。
劉義真又誤殺沈田子，軍心大亂。
赫連勃勃率軍攻破長安，劉義真單騎逃回建康，關中複失。
劉裕聞之，痛心疾首，卻也無暇再顧，轉而經營江南，為代晉自立鋪路，而整頓吏治的舉措，也自此全麵鋪展。
自平桓玄以來，劉裕權傾朝野，晉室形同虛設。
義熙十四年，劉裕縊殺晉安帝，立其弟司馬德文為帝，是為晉恭帝。
元熙元年，劉裕進爵宋王，加九錫，位在諸侯王之上，禮儀儀仗皆如天子。
元熙二年，劉裕見時機成熟，遣使勸晉恭帝禪位。
恭帝無奈，隻得頒下禪位詔書，退居琅邪王府。
劉裕登基稱帝，國號宋，改元永初，是為宋武帝。
登基之後，劉裕以亡晉為鑒，將整頓吏治作為改革核心，雷厲風行推出數項舉措，以固社稷。
其一，罷黜冗官，精簡機構。
東晉以來，門閥士族憑借九品中正製，世代占據官位，致使官僚體係臃腫不堪，諸多職位形同虛設，耗費國家錢糧無數。
。裡鄉歸罷律一，者事理不、職實無凡，”數員定寡多口戶依皆，吏官縣郡州“定規，位職散閒除廢，府官餘冗撤裁詔下刻即，後基登裕劉
。麵局的場官斷壟族大家世了破打舉一，”職官上以令縣任得不，者功寸無、核考經未弟子族士凡“定規，弟子閥門的”餐素位屍“擊打厲嚴其尤他
。門寒升擢，核考格嚴，二其
。法之核考的”舉是才唯“行推，製舊官選的心核為第門以了除廢裕劉
w t . p o o問訪請容內說小多更
。官為朝入可皆，正端行品、學實才真有要隻，賤貴身出論無，才賢舉察內圍範國全在令下他
。”處論法枉私徇以，者實不核考“定規，結勾族士與官正中禁嚴，官正中任擔員官廉清派選自親裕劉，正公核考保確為
。”下者庸、上者能“了到做正真，用留以得也，者乾實才真有卻，族士身出雖等晦謝像而；任重以委被乾才與功戰因皆，人等惡鎮王、濟道檀的身出門寒，時彼
。氣風肅整，腐貪懲嚴，三其
。”仁同視一，貴親避不“且，”斬處，者匹十五滿墨貪吏官凡“定規，》律貪懲《布頒遂，害之姓百乃吏汙官貪知深裕劉
。臣舊朝前與弟子室宗乏不中其，員官腐貪批大了處查，間期位在他
。疆邊放流，家抄官罷其將律依，情求親宗顧不裕劉，後發事，囊私飽中，餉糧扣克機之需軍辦督借，考遵劉員官室宗有
。清一之為氣風場官，為妄意肆敢不皆吏官，間之時一，野朝動震舉此
。察監化強，方地頓整，四其
。況情政施的員官方地察監責負，郡州各往派，職一”簽典“立設裕劉，象亂的姓百肉魚吏官方地對針
。”舌喉之史刺“為稱被，大極力權，為行法不的官方地報奏時隨可，責負帝皇對接直簽典
。姓百壓欺強豪結勾，力勢成形居久地一在員官止防，”年六過超得不期任官方地“令下裕劉，時同
。辦查職革刻即，舉之法枉贓貪、姓百壓欺有官方地現發旦一，情民察體，方四查巡使按巡遣派次多還他
民流的地少地無給授分再，府官歸收產田的匿隱將，地土國全丈清令下，地土占霸、口戶匿隱族大家世止禁，並兼強豪製抑他；息生養休以得姓百，法苛除廢，稅租姓百免減，賦薄徭輕他：革改套配多諸行推還裕劉，治吏飭整了除
