動物界之後口動物（deuterostomia）中的脊索動物門（chordata）包括三個主要的亞門，每個亞門下又分為多個綱。以下是脊索動物門的完整分類（至綱級）：
1. 尾索動物亞門（Urochordata，或稱被囊動物 tunicata）
綱：
海鞘綱（Ascidiacea）：成體固著生活，幼體有尾狀結構。
樽海鞘綱（thaliacea）：自由浮遊，桶狀身體。
尾海鞘綱（Appendicularia，或稱幼形綱 Larvacea）：終生保留幼體形態，自由生活。
2. 頭索動物亞門（cephalochordata）
綱：
文昌魚綱（Leptocardii）：僅包含文昌魚等頭索動物，脊索貫穿全身。
3. 脊椎動物亞門（Vertebrata，或有頭動物 craniata）
無頜總綱（Agnatha）：原始無頜類脊椎動物。
盲鰻綱（myxini）：無真正脊椎，具軟骨顱骨。
七鰓鰻綱（petromyzontida）：部分寄生生活，有吸附式口器。
?盔甲魚綱（osteostraci）：已滅絕的化石類群。
?異甲魚綱（heterostraci）：已滅絕的化石類群。
有頜總綱（Gnathostomata）：具頜脊椎動物。
軟骨魚綱（chondrichthyes）：如鯊魚、鰩魚，骨骼為軟骨。
?盾皮魚綱（plarmi）：已滅絕的早期有頜類。
輻鰭魚綱（Actinopterygii）：現代魚類的主流類群（如鯉魚、鮭魚）。
肉鰭魚綱（Sarcopterygii）：包括肺魚和四足動物的祖先。
肺魚亞綱（dipnoi）：能用肺呼吸的魚類。
四足形亞綱（tetrapodomorpha）：演化出四足動物（包括陸地脊椎動物）。
兩棲綱（Amphibia）：如青蛙、蠑螈，幼體水生，成體部分陸生。
爬行綱（Reptilia）：如蜥蜴、蛇、龜、鱷魚（傳統分類包含鳥類，但現代分類常將鳥類單獨列出）。
鳥綱（Aves）：由恐龍演化而來，恒溫，有羽毛。
哺乳綱（mammalia）：具乳腺和毛發，如人類、鯨類、齧齒類。
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? 表示已滅絕的類群。
部分傳統分類可能將 圓口綱（cyclostomata） 作為盲鰻和七鰓鰻的合並分類，但現代研究常將其分為兩個獨立的綱。
脊椎動物的分類存在不同觀點，例如鳥類有時被歸入爬行綱（基於共同祖先）。
棘皮動物門（Echinodermata）是後口動物（deuterostomia）的重要類群，以其五輻射對稱（成年個體）和水管係統為特征。現存的棘皮動物分為 5個綱，另有多個已滅絕的類群。以下是完整分類（至綱級）：
現存綱（現代棘皮動物）
1. 海星綱（Asteroidea）
特征：星形身體，腕與中央盤界限不明顯，管足用於運動和捕食。
例子：海星（如 Asterias）、太陽海星（Solaster）。
2. 蛇尾綱（ophiuroidea）
特征：中央盤與細長腕界限明顯，腕靈活，管足退化（無吸盤）。
例子：陽遂足（如 ophiura）、筐蛇尾（Gorgonocephalus）。
3. 海膽綱（Echinoidea）
>P/<。刺的動可具，”殼“硬堅為合愈骼骨，形圓扁或形球：征特
>P/<：綱亞
>P/<。）sutortnecolygnortS 膽海糞馬如（稱對射輻五：）airalugeR（綱亞膽海形正
>P/<。）膽海形心、錢沙如（稱對側兩：）airalugerrI（綱亞膽海形歪
>P/<）aedioruhtoloh（綱參海 .4
>P/<。部口繞環手觸具，片骨小微為化退骼骨，狀蟲蠕：征特
>P/<。）airamucuc（參瓜、）supohcitS（參刺：子例
>P/<）aedionirc（綱合百海 .5
>P/<。性食濾，叉分狀羽腕，活生由自或柄具：征特
>P/<：型類
>P/<。）合百海海深如（活生著固：合百海柄有
>P/<。泳遊由自，柄無：）adiluta（類星羽
>P/<）群類石化（綱絕滅已
>P/<。殼外狀萼具，代生古：）aediotsyc（綱檎林海?
>P/<。體身狀蕾花，代生古：）aediotsalb（綱蕾海?
>P/<。活生著附平扁，代生古：）aedioretsaoirdE（綱星座海?
>P/<。間之檎林海與合百海於介態形，代生古：）aedionircarap（綱合百海擬?
>P/<結總征特鍵關
>P/<。）稱對側兩出生衍群類分部膽海和參海（稱對射輻五為多體成，稱對側兩蟲幼：性稱對
通，統係動運壓水的特獨：統係管水
