朝廷，官職還在眾多功臣之上，心裡就很不踏實。所以每次被劉秀召見時，他的態度都特別恭敬，說話也小心翼翼的，生怕有一點不妥之處，而劉秀反而因此對他越發親近優待。
竇融這人做事一貫小心謹慎，長時間處於高位，心裡總是七上八下的。他好幾次向劉秀提出辭去官職爵位，還上奏章說：“我竇融有個兒子，我每天都督促他學習儒家經典，從不讓他去研究天文知識，也不讓他讀那些讖緯預言的書。我就盼著他能老老實實、規規矩矩的，本本分分走正道，壓根不指望他有啥特別出眾的才能，更沒想過讓他繼承我的封地，享受諸侯王那樣的待遇。”之後，竇融還想找機會單獨麵見劉秀，當麵再提辭職的事兒，可劉秀一直沒答應。
有一次朝會結束，別人都走了，竇融卻留在原地磨磨蹭蹭的不想走。劉秀一看就明白他還是想辭職，這次沒等他開口，劉秀就示意身邊的侍從把他“請”出去了。過了幾天，兩人再次見麵，劉秀直接就對竇融說：“前幾天我就知道你想辭官、還封地，所以故意讓你趁著天熱好好休息休息。今天咱們見麵，就聊點別的，辭職這事兒以後你就別提了。”竇融聽劉秀都把話說到這份上了，也就不敢再提辭職的事兒了。
公元38年的夏季，邛穀王任貴派遣使者呈上三年的計簿，隨即他就被任命為越巂太守。
在這一年的秋天，會稽地區突然被一場可怕的瘟疫所籠罩。這場瘟疫來勢洶洶，而且迅速蔓延，給當地的居民帶來了巨大的災難和痛苦。人們驚恐地發現，身邊的親朋好友紛紛病倒，症狀嚴重且相似，許多人因此失去了生命。
莎車王賢和鄯善王安派使者到漢朝進貢。西域各個國家被匈奴征收的賦稅壓得喘不過氣，日子過得特別艱難，所以都想歸附漢朝，他們還請求漢朝重新設置都護府來管理西域。但劉秀覺得中原地區剛剛安定下來，目前還顧不上西域那邊，所以就沒答應他們的請求。
這時，太中大夫梁統給劉秀上書說：“我仔細研究發現，漢元帝初元五年的時候，國家減少了三十四項死刑罪名；漢哀帝建平元年時，又減少了八十一項死刑罪名，其中有四十二項涉及親手殺人的，把死刑減為了次一等的刑罰。從那以後，這些就成了慣例，結果導致老百姓不把犯法當回事，官吏有時也隨隨便便的就殺人。我聽說治理國家，要以仁義為本，仁就是愛護百姓，義就是匡正事理。愛護百姓就要鏟除殘暴的人，匡正事理就要消除混亂的局麵，刑罰的輕重一定要合適，不能太寬鬆。當年漢高祖順應天命，製定的法律就很恰當；漢文帝隻廢除了肉刑和連坐法，其他的基本都沿用舊製。等到漢哀帝、漢平帝即位時，他們在位時間不長，處理的案子也少。丞相王嘉卻隨隨便便修改法律，從而破壞了先帝定下的規矩，短短幾年時間就改了一百多項，有些改得既不合道理，又讓百姓不滿意。現在我把其中那些對國家製度危害最大的部分，都附在了奏章後麵。希望陛下能下令讓相關部門，仔細研究篩選出合理的部分，製定成不能輕易改動的法典。”隨後，劉秀就把這事交給公卿大臣們去討論。
光祿勳杜林也上奏說：“漢朝剛建立的時候，廢除了秦朝那些嚴苛的法令，因此天下百姓都特別高興。可是後來，法律卻越來越繁瑣。就連送點水果、桃子、蔬菜這樣的小事，都能被當成貪汙受賄，一些本來沒什麼大危害的小事，卻要受到重罰。結果搞得法律根本管不住人，朝廷發布的命令也沒人聽，官員上下互相推卸責任，問題是越來越嚴重了。我覺得現在應該恢複以前的舊製度，別輕易改動。”
梁統又一次上奏說：“我提這些建議，可不是主張用嚴刑峻法。《經》書上說：‘治理百姓，刑罰要適中。’適中的意思，就是既不能太重，也不能太輕。從漢高祖到漢宣帝的時候，天下治理得很好；可到了初元、建平年間，盜賊卻越來越多，就是因為刑罰不合適，讓那些心存僥幸的人覺得犯法成本低，所以才敢輕易去犯罪。這麼看來，刑罰太輕反而會帶來大麻煩，這就是在縱容壞人，卻害苦了老實的老百姓啊！”但梁統的這些建議，最後還是被擱置在一邊，劉秀也沒給出明確的答複。
公元39年的春天正月，大司徒韓歆被罷官。韓歆這人性格直爽，說話直來直去，想到啥就說啥，就連劉秀有時候都受不了他這麼直白的說話方式。有一次，韓歆當著劉秀的麵預測會發生饑荒和災禍，說得特別激動，又是指天又是畫地的，結果就被罷官，最後被打發回了老家。可劉秀還是氣不過，就又派使者去責問他，韓歆和兒子韓嬰受不了，就自殺了。韓歆向來很有名望，他又沒犯啥大罪，就因為說話直落得這個下場，很多人都為他感到不值。劉秀後來也有點後悔，就給他追賜了錢糧，還按禮節安葬了他。
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