皇子劉黨賜了重熹王的稱號，但都沒給他們分封自己的封國。
明帝還特別重視儒家學說，上到太子、各個王爺、侯爵，下到高官子弟、功臣後代，沒有一個不學習儒家經典的。他還在南宮專門給外戚樊家、郭家、陰家、馬家的孩子們辦了學校，這些學生被叫做“四姓小侯”。明帝又給他們找來了講解儒家《五經》的老師，還特意挑選學問特別好的人來教書。就連皇宮裡負責保衛的期門、羽林等武官，也都要求讀懂《孝經》裡的基本內容。匈奴那邊知道後，也派了貴族家的孩子來漢朝學習儒家文化。
就在這時，廣陵王劉荊又找來一個會看相的人，問他：“你看我的長相和先帝（劉秀）那麼像。先帝30歲的時候就當了皇帝，我現在也30歲了，我是不是也能起兵奪取皇位了？”結果這個看相的轉頭就把這事彙報給了官府。劉荊一聽那是相當害怕，就趕緊自己跑到監獄裡把自己關了起來。明帝念在兄弟情分上，就沒有追究這件事，隻是下詔書，不讓他再管理封國的官員和百姓了，但是還能繼續享受封國的賦稅收入，同時讓封國的國相和中尉盯著他，防止他再鬨事。
可劉荊就是不安分，又找來巫師詛咒別人。明帝知道後，就讓長水校尉樊等人一起審理這個案子。審完之後，樊等人就給明帝上書，請求處死劉荊。明帝生氣地說：“就因為廣陵王是我弟弟，你們就想殺他？要是我的兒子，你們還敢這麼說嗎？”樊回答道：“這天下是漢高祖打下來的天下，不是陛下一個人的天下。按照《春秋》裡的道理，皇帝的近親要是有謀反的心思，就得殺。我們是因為劉荊是陛下的同母弟弟，陛下一直對他很關照，我們才特意來請示。要是陛下的兒子乾這事，我們直接就處置了。”明帝聽了，雖然歎氣，但也覺得他說得有道理。這個樊，就是樊宏的兒子。
公元67年二月，廣陵王劉荊就自殺了，封國也被撤除了。
四月，朝廷宣布大赦天下。
閏十月的時候，明帝就到南陽視察情況。在南陽，他把當地學校的學生召集起來，讓他們演奏莊重的廟堂音樂。當學生們演奏《詩經·鹿鳴》這首曲子時，明帝也來了興致，就親自拿起陶塤和竹篪這兩種樂器，和學生們的演奏配合起來，讓在場的賓客都看得很開心。在回京城的路上，明帝又順路去了南頓。到了十二月，他才回到皇宮。
在這之前，陵陽侯丁綝去世了，按照規矩，他的兒子丁鴻應該繼承他的封國。但丁鴻卻給朝廷上書，說自己生病了，想把封國讓給弟弟丁盛，可朝廷沒有同意他的請求。丁鴻在把父親安葬好之後，直接就把喪服掛在守墓的小屋裡，然後偷偷跑掉了。
後來，丁鴻的朋友，九江人鮑駿在東海國碰上了丁鴻，就批評他說：“以前孤竹君的兒子伯夷和吳王的兒子季劄推辭王位，那是在亂世中不得已的做法，隻有那樣才能顯示他們的氣節。但按照《春秋》裡的道理，不能因為家裡的事而耽誤國家的事。現在你為了兄弟感情，就放棄父親辛苦掙下的、可以世代傳承的封國，這怎麼能行呢？”
丁鴻聽了這番話，一下子就明白了，忍不住流下了眼淚，隨後就回去繼承了封國。鮑駿覺得丁鴻知錯能改，還很有學問，品德也好，就向朝廷推薦了他。明帝聽說後，就把丁鴻召進京城，還任命他做了侍中。
公元68年正月，東平王劉蒼和其他親王一起到京城，向明帝朝拜請安。在京城待了一個多月後，他們就準備返回各自的封國。明帝親自去給他們送行，送完回到皇宮後，明帝心裡感覺空落落的，滿是對劉蒼等人的不舍和思念。
於是，明帝就提筆寫了一道詔書，派使者送到東平國，交給東平國的中傅（輔佐親王的官員）。詔書裡說：“和你們分開後，我一個人坐著，心裡感到特別難受，坐車回皇宮的路上，我低著頭靠在車前的橫木上，一邊走一邊想你們，越想心裡越不是滋味。讀著《詩經·采菽》這首詩，更是忍不住唉聲歎氣。之前我問東平王：‘平常在家做什麼最開心？’東平王回答說：‘做善事最讓我快樂。’這話聽著大氣得很，和他的胸懷氣度特別相配。現在送過去十九枚列侯印信，東平王家裡年滿五歲、懂得行禮的兒子，都可以佩戴這些印信。”
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