到尊崇寵愛，卻不以此為榮，常常麵帶憂慮。臨終時，還留下遺言說：“魏國有個正直的人，河內司馬孚，字叔達，不是伊尹也不是周公，不是伯夷也不是柳下惠，立身行道，始終如一。應當用當季的衣服入殮，用樸素的棺材安葬。”晉武帝下詔賜給他東園製作的溫明秘器（古代的一種葬具），各項禮儀都依照漢代東平獻王的舊例。但司馬孚的家人遵從他的遺願，朝廷所賜的器物全都沒有使用。
晉武帝和右將軍皇甫陶討論國事，皇甫陶和武帝爭論起來，散騎常侍鄭徽上表請求治皇甫陶的罪，武帝說：“忠誠正直的言論，朕隻怕聽不到。鄭徽越職胡亂上奏，這不是我的意思！”於是罷免了鄭徽的官職。
夏季，汶山白馬胡侵擾掠奪各部落，益州刺史皇甫晏想討伐他們。典學從事蜀郡人何旅等人勸諫說：“胡夷互相殘殺，本來是他們的常性，根本算不上大患。現在盛夏出兵，加上雨季將要到來，必定會有瘟疫，應該等到秋冬再謀劃這件事。”可皇甫晏不聽。胡人康木子燒香說出兵必定失敗，皇甫晏認為他動搖軍心，就把他殺了。軍隊到達觀阪，牙門張弘等人因汶山道路險要，且害怕胡人的兵力，就趁夜作亂，殺死了皇甫晏，軍中驚慌混亂，兵曹從事犍為人楊倉率兵奮力抵抗而死。張弘於是誣陷皇甫晏，說“他率領我們一起謀反”，所以殺了他，並把首級傳送到京師。皇甫晏的主簿蜀郡人何攀，正在為母親守喪，聽到消息後，就到洛陽證明皇甫晏沒有謀反，而張弘等人放縱士兵搶劫掠奪。廣漢主簿李毅對太守弘農人王濬說：“皇甫侯出身儒生，有什麼追求而要謀反呢！況且廣漢和成都靠近，卻隸屬於梁州，是朝廷想用來控製益州的要害，正是為了防備今天這樣的變故。現在益州有叛亂，也是本郡的憂患。張弘是個小人，眾人都不依附他，應該立即出兵討伐，不能錯失時機。”王濬想先上奏請示，李毅說：“殺害主官的叛賊，罪惡極大，應當不拘泥於常規，有什麼可請示的！”王濬於是發兵討伐張弘。晉武帝下詔任命王濬為益州刺史。王濬攻打張弘，成功將他斬首，並誅滅三族。隨後，晉國封王濬為關內侯。
起初，王濬擔任羊祜的參軍，羊祜很了解他。羊祜哥哥的兒子羊暨說王濬“為人誌向遠大但奢侈，不能專任，應該有所約束”。羊祜說：“王濬有大才，會實現他的願望，一定可以任用。”後來王濬改任車騎從事中郎。王濬在益州，明確樹立威信，蠻夷大多歸附他；不久升任大司農。當時晉武帝和羊祜暗中謀劃討伐吳國，羊祜認為伐吳應該借助上遊的地勢，便秘密上表請求留下王濬再次擔任益州刺史，讓他訓練水軍。不久又加授他龍驤將軍，監益、梁諸軍事。
晉武帝下詔讓王濬解散屯田兵，開始大規模建造戰船。別駕何攀認為“屯田兵不過五六百人，造船不能很快完成，後麵的還沒造好，前麵的已經腐朽了。應該召集各郡的士兵合計一萬多人來建造，年底就能完成。”王濬想先上奏等待批複，何攀說：“朝廷突然聽說要召集一萬士兵，必定不會同意；不如自行召集，假如被駁回，功夫已經做成，形勢也讓朝廷無法阻止。”王濬聽從了他的建議，就命令何攀負責建造戰船和兵器。於是建造大艦，長一百二十步，能容納兩千多人，用木頭建成城郭，並築起了望樓，開通四麵的門，艦上都能騎馬往來。當時造船的木屑順江而下，吳國建平太守吳郡人吾彥撈起漂流的木屑報告吳主說：“晉朝必定有攻打吳國的計劃，應該增加建平的兵力來堵塞要害之處。”可吳主不聽。吾彥於是用鐵鎖橫斷長江水路。
王濬雖然接受朝廷的命令招募士兵，卻沒有虎符；廣漢太守敦煌人張斅逮捕了他的從事並上報。隨後，晉武帝召張斅回朝，並責備他說：“你為什麼不秘密上奏卻要直接逮捕從事？”張斅說：“蜀、漢地勢偏遠，劉備曾憑借這裡割據。我擅自逮捕，還覺得處罰輕了。”晉武帝聽後，也認為他說得對。
壬辰日，晉國大赦天下。
秋季，七月，晉國任命賈充為司空，侍中、尚書令、領兵的職務依舊保留。賈充和侍中任愷都受到晉武帝的寵信重用，賈充想獨攬名利權勢，因而忌恨任愷，於是朝廷官員各自依附一方，派係紛爭不斷。晉武帝知道後，便召賈充、任愷在式乾殿宴飲，並對他們說：“朝廷應該統一，大臣應當和睦。”賈充、任愷聽後，各自下拜謝罪。不久，賈充、任愷因為武帝已經知道卻沒有責備，所以行事更加無所顧忌，兩人表麵上互相尊重，內心的怨恨卻更深了。賈充於是推薦任愷擔任吏部尚書，任愷覲見武帝的機會變少，賈充便趁機和荀勖、馮紞一起誣陷他，任愷因此獲罪，被罷官閒居家中。
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