，司馬顒抓住他責問，張光說：“劉雍州不采用我的計策，所以才讓您有今天！”司馬顒認為他有膽識，便帶他一起歡宴，上表推薦他為右衛司馬。
羅尚逃到江陽，派遣使者上奏情況，詔書讓羅尚暫時統領巴東、巴郡、涪陵，來供給軍事賦稅。羅尚派遣別駕李興到鎮南將軍劉弘那裡請求糧食，劉弘的主簿因運輸道路艱險遙遠，而且荊州自身也空虛匱乏，想把零陵的五千斛米給羅尚。劉弘說：“天下是一家，彼此沒有差別，我現在供給他，就沒有西顧的憂慮了。”於是用三萬斛米接濟羅尚，羅尚靠這些米得以生存。李興希望留下做劉弘的參軍，劉弘奪下他的手板，就把他打發走了。劉弘又派遣治中何鬆領兵駐紮在巴東作為羅尚的後援。當時在荊州的流民有十多萬戶，他們客居他鄉，生活貧困，很多人成為盜賊，劉弘給他們大量的田地和種子，並選拔其中的賢才，根據他們的才能任用，流民於是安定下來。
二月，乙酉日，丞相司馬穎上奏表請求廢黜皇後羊氏，將她幽禁在金墉城，廢黜皇太子司馬覃為清河王。
陳敏與石冰交戰數十次，石冰的部眾是陳敏的十倍，但陳敏攻打他們，所到之處都取得勝利，於是與周玘合力在建康攻打石冰。三月，石冰向北逃跑，投奔封雲，封雲的司馬張統斬殺石冰和封雲後投降，揚州、徐州這才得以平定。周玘、賀循都遣散部眾回家，不提功勞賞賜。朝廷任命陳敏為廣陵相。
河間王司馬顒上奏表請求立丞相司馬穎為皇太弟。戊申日，朝廷下詔立司馬穎為皇太弟，都督中外諸軍事，丞相之職依舊保留。隨後大赦天下。皇帝的車駕、服飾等都遷到鄴城，製度全依照魏武帝曹操的舊例。又任命司馬顒為太宰、大都督、雍州牧；前太傅劉實為太尉。劉實因年老，堅決辭讓不接受任命。皇太弟司馬穎越禮奢侈一天比一天嚴重，寵幸的小人當權，大失眾人所望。司空東海王司馬越，與右衛將軍陳眕，以及長沙王司馬乂過去的部將上官巳等人謀劃討伐他。秋季，七月，丙申朔日，陳眕領兵進入雲龍門，以詔書召集三公百官和殿中人員，戒嚴討伐司馬穎，石超逃奔鄴城。戊戌日，大赦天下，恢複皇後羊氏和太子司馬覃的地位。己亥日，司馬越侍奉皇帝北征，任命司馬越為大都督。征召前侍中嵇紹到皇帝的駐地。侍中秦準對嵇紹說：“如今前去，安危難料，你有好馬嗎？”嵇紹神色嚴肅地說：“臣子護衛皇帝，生死都交給國家，要好馬做什麼！”
司馬越發布檄文召集各地軍隊，前來響應的人很多，等到達安陽時，部眾已有十多萬，鄴城中的人非常震驚恐懼。司馬穎召集眾僚屬商議對策，東安王司馬繇說：“天子親自出征，應該脫下鎧甲、穿上白色喪服出城迎接，好認罪請罰。”但司馬穎不聽，隻派遣石超率領五萬部眾抵抗。折衝將軍喬智明勸司馬穎迎接皇帝，司馬穎發怒說：“你號稱通曉事理，投身輔佐我；如今主上被一群小人逼迫，你怎麼想讓我束手就擒接受刑罰呢！”
陳眕的兩個弟弟陳匡、陳規從鄴城趕到皇帝駐地，說鄴城中的人都已離散，因此朝廷軍隊不怎麼設防。己未日，石超的軍隊突然趕到，皇帝的軍隊在蕩陰戰敗，皇帝臉頰受傷，中了三箭，百官侍從都逃散了。嵇紹穿著朝服，下馬登上皇帝的車駕，用身體護衛皇帝，士兵把嵇紹拉到車轅中砍殺。皇帝說：“這是忠臣，不要殺他！”士兵回答說：“我們奉太弟的命令，隻不侵犯陛下一人而已！”於是殺死了嵇紹，鮮血都濺到了皇帝的衣服上。皇帝跌落在草叢中，丟失了六枚玉璽。石超侍奉皇帝到他的軍營，皇帝非常饑餓，石超送上水，身邊的人獻上秋桃。司馬穎派盧誌迎接皇帝；庚申日，皇帝進入鄴城。隨即大赦天下，改年號為建武。身邊的人想洗皇帝的衣服，皇帝說：“上麵有嵇侍中的血，不要洗！”
陳眕、上官巳等人侍奉太子司馬覃守衛洛陽。司空司馬越逃奔下邳，但徐州都督東平王司馬楙不接納他，司馬越直接回到東海。皇太弟司馬穎因司馬越是宗室中有聲望的人，又是自己的兄長，就下令招撫他，司馬越不接受命令。前奮威將軍孫惠上書勸司馬越聯合各藩王，共同輔助王室。司馬越任命孫惠為記室參軍，讓他參與謀劃商議。北軍中候苟曦逃奔範陽王司馬虓，司馬虓秉承皇帝旨意任命苟曦代理兗州刺史。
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