逃，陳朝其他各軍看到後，騎兵步兵大亂，潰不成軍，無法阻止，死者達五千人。員明活捉蕭摩訶，將他押送到賀若弼麵前，賀若弼下令將其斬首，蕭摩訶神色自若，賀若弼便釋放了他並以禮相待。
任忠馳馬進入台城，拜見陳後主，陳述戰敗的情況，說：“陛下好自為之，我已無能為力了！”陳後主交給任忠兩箱黃金，讓他招募士兵出戰。任忠說：“陛下應當準備船隻，前往上遊投靠援軍，我會以死保衛陛下。”陳後主相信了他的話，下令任忠出去部署，又讓宮女收拾行裝等待出發，卻奇怪任忠許久沒有回來。當時韓擒虎已從新林進軍，任忠卻率領幾名騎兵在石子岡投降了隋軍。領軍蔡征駐守朱雀航，聽說韓擒虎將至，士兵們都驚恐潰散。任忠引導韓擒虎的軍隊徑直進入朱雀門，陳朝士兵想要抵抗，任忠揮手說：“老夫尚且投降，你們還抵抗什麼！”士兵們聽後紛紛散去。於是城內的文武百官都逃跑了，隻有尚書仆射袁憲留在殿中，尚書令江總等幾人留在尚書省。陳後主對袁憲說：“我向來對待你不如其他人，如今才深感慚愧。這不隻是我沒有德行，也是江東士大夫的氣節喪失殆儘了！”
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陳後主驚慌失措，想要躲藏起來，袁憲神色嚴肅地說：“隋軍進入皇宮後，必定不會侵犯陛下。大事已然如此，陛下還能躲到哪裡去！我希望陛下整理好衣冠，登上正殿，依照梁武帝接見侯景的舊例應對。”陳後主不聽，走下坐榻飛奔而去，說：“刀劍之下，不能抵擋，我自有辦法！”然後帶著十多名宮女逃出後堂景陽殿，準備投井自儘，袁憲苦苦勸阻，陳後主不聽；後閣舍人夏侯公韻用身體擋住井口，陳後主與他爭執了很久，才得以跳入井中。不久，隋軍士兵窺探到井裡有人，呼喊時沒有回應，準備往下扔石頭，才聽到叫聲；用繩子往上拉時，驚訝於重量之大，拉上來後，才發現陳後主與張貴妃、孔貴嬪綁在一起。沈皇後則像往常一樣安居在宮中。太子陳深當時十五歲，閉門而坐，舍人孔伯魚在一旁侍奉，隋軍士兵敲門進入，陳深安然端坐，安慰他們說：“行軍途中，不必勞累！”士兵們都向他致敬。當時在建康的陳朝宗室王侯有一百多人，陳後主擔心他們發動叛亂，便將他們全部召入宮中，讓他們駐守朝堂，派豫章王陳叔英統領，又暗中加以防備，等到台城失守，這些宗室王侯都相繼出城投降。
賀若弼乘勝進軍到樂遊苑，魯廣達還率領殘餘士兵苦戰不止，殺死俘獲隋軍數百人，恰逢日暮時分，才脫下鎧甲，麵向台城拜了兩拜，放聲痛哭，對部下說：“我不能拯救國家，罪責深重啊！”士兵們聽後都流下眼淚，隨後魯廣達被隋軍活捉。各處宮門的守衛都逃跑了，賀若弼在夜間焚燒北掖門進入皇宮，聽說韓擒虎已經抓獲陳叔寶，便派人叫來查看，陳叔寶十分恐懼，汗流浹背、雙腿發抖，向賀若弼拜了兩拜。賀若弼對他說：“小國的君主拜見大國的卿相，跪拜是合乎禮儀的。入朝後不會失去歸命侯的爵位，不必過分恐懼。”不久，賀若弼因功勞在韓擒虎之後而感到羞恥，與韓擒虎發生爭執，甚至拔劍出鞘；還想讓蔡征為陳叔寶撰寫降書，命令陳叔寶乘坐騾車歸附自己，最終沒有成功。賀若弼將陳叔寶安置在德教殿，派兵守衛。
高熲先進入建康，他的兒子高德弘擔任晉王楊廣的記室，楊廣派高德弘騎馬趕到高熲那裡，命令留下張麗華。高熲說：“從前薑太公蒙麵斬殺妲己，如今怎能留下張麗華！”於是在青溪將張麗華斬首。高德弘返回報告，楊廣臉色大變，說：“古人說‘無德不報’，我一定會報複高公！”從此怨恨高熲。
丙戌日，晉王楊廣進入建康，認為施文慶接受委托卻不忠不義，刻意諂媚討好來蒙蔽君主，沈客卿橫征暴斂來取悅上級，與太市令陽慧朗、刑法監徐析、尚書都令史暨慧都是禍害百姓的奸臣，將他們在石闕下斬首，以告慰三吳地區的百姓。命令高熲與元帥府記室裴矩收集陳朝的地圖戶籍，封存府庫，對財物絲毫不取，天下人都稱讚楊廣，認為他賢明。裴矩是裴讓之的侄子。
楊廣因賀若弼提前決戰，違反了軍令，將他逮捕交給司法官員處置。隋文帝派驛使召見賀若弼，下詔給楊廣說：“平定江南，是賀若弼與韓擒虎的功勞。”賞賜賀若弼一萬段財物；又分別下詔給賀若弼和韓擒虎，讚美他們的戰功。
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