回丹楊，敵軍被殺死、淹死的有一萬多人。李靖的軍隊率先抵達丹楊，輔公祏十分恐懼，率領數萬士兵棄城向東逃跑，想要前往會稽投靠左遊仙，李世積率軍追擊。輔公祏到達句容時，隨從的士兵隻剩下五百人，夜晚在常州宿營，他的將領吳騷等人密謀擒獲他。輔公祏察覺後，拋棄妻子兒女，獨自率領幾十名心腹，衝破關卡逃走。到達武康時，遭到山野百姓的攻擊，西門君儀戰死。百姓擒獲輔公祏，押送到丹楊斬首，隨後搜捕他的殘餘黨羽，全部處死，江南地區全部平定。
己亥日，朝廷任命李孝恭為東南道行台右仆射，李靖為兵部尚書。不久後，廢除行台，任命李孝恭為揚州大都督，李靖為都督府長史。高祖高度讚賞李靖的功勞，說：“李靖是蕭銑、輔公祏的克星啊。”
闞棱功勞很大，頗為自誇。輔公祏誣陷闞棱與自己勾結。恰逢趙郡王李孝恭抄沒賊黨的田地住宅，闞棱以及杜伏威、王雄誕在賊境中的田地住宅，都被李孝恭一並抄沒；闞棱上書申訴，觸犯了李孝恭，李孝恭大怒，以謀反的罪名處死闞棱。
夏季，四月庚子朔日，朝廷大赦天下。當天，頒布新的律令，相比開皇年間的舊製新增五十三條格。
朝廷初步製定均田製和租庸調法：成年男子、中年男子，每人分給一頃田地，重病患者減去十分之六，寡妻寡妾減去十分之七；其中十分之二為世業田，十分之八為口分田。每個成年男子每年繳納租粟二石。調根據土地所產，繳納綾、絹、絁、布等。每年服役二十天；不服役的人繳納庸，每天三尺布；因事需要增加服役的，加役十五天，免征調；加役三十天，租、調都免征。遭遇水、旱、蟲、霜等災害，損失四成以上免征租，損失六成以上免征調，損失七成以上租、調、役都免征。百姓的財產分為九等。一百戶為一裡，五裡為一鄉，四家為一鄰，四鄰為一保。在城鎮的稱為坊，在鄉村的稱為村。享受俸祿的官員，不得與百姓爭奪利益；工匠、商人等雜類，不得加入士人隊伍。男女剛出生為黃籍，四歲為小，十六歲為中，二十歲為丁，六十歲為老。每年編製計帳，每三年編製一次戶籍。
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丁未日，黨項侵犯鬆州。庚申日，通事舍人李鳳起攻打萬州反叛的獠人，平定叛亂。
五月辛未日，突厥侵犯朔州。甲戌日，羌人與吐穀渾一同侵犯鬆州。朝廷派遣益州行台左仆射竇軌從翼州道出兵，扶州刺史蔣善合從芳州道出兵，討伐他們。丙戌日，在宜君修建仁智宮。丁亥日，竇軌在方山擊敗反叛的獠人，俘獲兩萬多人。
六月辛醜日，唐高祖前往仁智宮避暑。辛亥日，瀧州、扶州的獠人作亂，朝廷派遣南尹州都督李光度等人率軍平定叛亂。丙辰日，吐穀渾侵犯扶州，刺史蔣善合擊退敵軍。壬戌日，慶州都督楊文乾反叛。
當初，齊王李元吉勸說太子李建成除掉秦王李世民，說：“我會為兄長親手殺死他！”李世民跟隨高祖前往李元吉的府邸，李元吉在臥室裡埋伏了護軍宇文寶，想要刺殺李世民；李建成性情較為仁厚，急忙阻止了他。李元吉惱怒地說：“這都是為兄長著想，對我有什麼好處！”
李建成擅自招募長安及各地驍勇之士兩千多人作為東宮衛士，分別駐紮在左、右長林門，號稱“長林兵”。又秘密派右虞侯率可達誌跟隨燕王李藝征調幽州突騎三百人，安置在東宮東邊的各坊，準備補充東宮的警衛力量，此事被人告發。高祖召見李建成並責備他，將可達誌流放到巂州。
楊文乾曾經在東宮擔任警衛，與李建成關係親密，李建成私下讓他招募壯士送到長安。高祖將要前往仁智宮，命令李建成留守長安，李世民、李元吉一同隨行。李建成讓李元吉趁機圖謀李世民，說：“安危大計，就在今年決定！”又派郎將爾朱煥、校尉橋公山將鎧甲送給楊文乾。二人走到豳州時，上書告發太子指使楊文乾起兵謀反，與東宮內外呼應；還有寧州人杜鳳舉也前往仁智宮稟報此事。高祖大怒，借口其他事情，親手寫下詔書召見李建成，讓他趕赴行宮。李建成感到恐懼，不敢前往。太子舍人徐師謨勸他占據長安起兵；詹事主簿趙弘智則勸他降低車駕規格，精簡隨從，前往行宮請罪，李建成於是前往仁智宮。距離行宮還有六十裡時，他將所有官屬留在毛鴻賓堡，隻帶十多名騎兵去見高祖，跪地叩頭請罪，甚至奮力磕頭直至昏厥。高祖怒氣未消，當晚將他安置在帳篷裡，隻給麥飯充饑，派殿中監陳福看守，同時派遣司農卿宇文穎急速召見楊文乾。宇文穎到達慶州後，將實情告知楊文乾，楊文乾隨即起兵反叛。高祖派遣左武衛將軍錢九隴與靈州都督楊師道率軍討伐。
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苑，日巳己月七，季秋
