貞觀二十年，公元646年，春季正月辛未日，夏州都督喬師望、右領軍大將軍執失思力等人率軍進攻薛延陀，大敗敵軍，俘獲兩千多人。多彌可汗率領輕騎兵逃走，薛延陀內部陷入騷亂。
丁醜日，太宗派遣大理卿孫伏伽等二十二人按照六條詔令巡察天下，刺史、縣令以下官員被大量貶斥罷免，這些人前往朝廷喊冤的，前後絡繹不絕。太宗讓褚遂良分類整理他們的訴狀後上報，親自臨朝裁決，提拔任用了二十人，處死七人，流放及以下被免職的有數百上千人。
二月乙未日，太宗從並州出發。三月己巳日，車駕返回京城。太宗對李靖說：“我率領天下大軍，卻被小小的夷族困住，這是為什麼？”李靖說：“這一點李道宗能解釋。”太宗回頭詢問江夏王李道宗，李道宗詳細陳述了在駐蹕山時建議乘虛奪取平壤的話。太宗悵然道：“當時事情匆忙，我已經不記得了。”
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太宗的病情沒有完全痊愈，想要專心調養，庚午日，下詔將軍政要務全部委托給皇太子處理。於是太子每隔一天在東宮處理政務，結束後就進入宮中侍奉太宗服藥膳食，不離左右。太宗讓太子暫時外出遊覽，太子推辭不願前往；太宗便在寢宮旁邊設置別院，讓太子居住。褚遂良請求讓太子每十天返回東宮一次，與師傅們探討道義；太宗采納了他的建議。
太宗曾前往未央宮，清道的儀仗隊已經走過，忽然在草叢中發現一個人身帶橫刀，於是就盤問他，那人回答說：“聽到清道的儀仗隊到來，害怕得不敢出來，清道的人沒看見我，我就趴在原地不敢動彈。”太宗立即率軍返回，回頭對太子說：“這件事如果按律處置，會有好幾個人被處死，你過後趕緊把他放了。”太宗還曾乘坐腰輿（一種輕便的轎子），有一名三衛（宮廷侍衛）不小心碰到了他的衣服，那人十分恐懼，臉色大變。太宗說：“這裡沒有禦史，我不怪罪你。”
陝州人常德玄告發刑部尚書張亮收養了五百名義子，與術士公孫常交談時，說“我的名字應驗了圖讖”，又問術士程公穎：“我手臂上長出了龍鱗，想要起兵乾大事，可以嗎？”太宗命令馬周等人審理此事，張亮拒不認罪。太宗說：“張亮收養五百名義子，養這些人做什麼？正是想要謀反！”下令文武百官商議這起案件，眾人都認為張亮謀反，應當處死。隻有將作少匠李道裕說：“張亮謀反的證據不足，罪行不該處死。”太宗派長孫無忌、房玄齡到獄中與張亮訣別說：“法律是天下公平的準則，我和你共同遵守。你自己不夠謹慎，與惡人交往，陷入法網，現在又能怎麼辦呢！你安心去吧。”己醜日，張亮與程公穎一同在西市被斬首，家產被查抄沒收。
一年多後，刑部侍郎一職空缺，太宗讓宰相們精心挑選合適的人選，擬定了幾個人選，都不符合太宗的心意，不久後太宗說：“我找到合適的人了。當初李道裕議論張亮的案件時說‘謀反證據不足’，這話是對的，我雖然沒有聽從，至今仍感到後悔。”於是任命李道裕為刑部侍郎。
閏月癸巳朔日，發生日食。戊戌日，撤銷遼州都督府和岩州。夏季四月甲子日，太子太保蕭瑀被免去太保職務，仍擔任同中書門下三品。
五月甲寅日，高麗王高藏及莫離支蓋金（即淵蓋蘇文）派遣使者前來謝罪，並獻上兩名美女，太宗將美女送回。
六月丁卯日，西突厥乙毘射匱可汗派遣使者入朝進貢，並且請求通婚；太宗答應了他的請求，還讓他割讓龜茲、於闐、疏勒、朱俱波、蔥嶺五國作為聘禮。
薛延陀多彌可汗性情偏激急躁，猜忌他人且毫無恩德，廢棄了父親在位時的權貴大臣，隻重用自己親近的人，國內百姓不歸附他。多彌可汗大肆誅殺異己，人們都感到不安。回紇酋長吐迷度與仆骨、同羅等部一起進攻他，多彌可汗大敗。乙亥日，太宗下詔任命江夏王李道宗、左衛大將軍阿史那社爾為瀚海安撫大使；又派遣右領衛大將軍執失思力率領突厥軍隊，右驍衛大將軍契苾何力率領涼州及胡人軍隊，代州都督薛萬徹、營州都督張儉各自率領本部軍隊，分兵幾路共同進攻薛延陀。
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