開了鍋。以山東籍官員和許多崇尚程朱理學的官員為首，形成了強大的保護勢力，他們痛心疾首，認為清吏司此舉是“褻瀆先聖”、“動搖國本”，紛紛上書為孔府辯護，攻擊陳子廷、朱統鑍“苛酷邀功”，甚至有人暗示這是沈驚鴻在背後推動，意圖“以法家之術取代儒家道統”。
就連一向支持清吏司的朱由校，麵對如此巨大的輿論壓力和涉及文化道統的敏感問題，也陷入了深深的猶豫。他召來魏忠賢、內閣輔臣，甚至罕見地主動谘詢沈驚鴻的意見。
沈驚鴻的回奏依舊簡潔而堅定：“陛下，清吏司所查，乃孔府門下之不法，非孔子之學說。尊聖在於敬其道，而非庇其不肖子孫。依法懲惡，方能彰顯陛下公允，維護聖道真正尊嚴。若枉法徇情，則律法威嚴掃地，朝廷信譽何存？”
與此同時，陳子廷和朱統鑍在山東頂住巨大壓力，拒不撤回奏章，並公開表示，願與任何人對質證據。
就在朝堂爭論不休、皇帝難以決斷之際，朱統鑍做了一件石破天驚的事情——他將在曲阜收集到的部分確鑿證據，尤其是關於孔府縱容家奴逼死佃戶、強占民田致人傾家蕩產的慘案細節，通過可靠的渠道，在士林清議中悄然散播開來。
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真相的力量是巨大的。儘管有官員極力遮掩，但這些血淋淋的事實還是在讀書人中間引起了劇烈的思想震動。原來，他們尊崇的聖裔府邸，竟也藏著如此肮臟的汙垢？
輿論開始出現微妙的分化。一些秉持公心的官員和士子開始轉而支持清吏司，要求“王子犯法與庶民同罪”，聖裔亦不能例外。
麵對確鑿的證據和開始轉變的輿論，以及沈驚鴻、魏忠賢（魏忠賢樂見清流代表的孔府吃癟）從不同角度的支持，朱由校終於做出了艱難的決定。
他下旨，首先重申了對至聖先師的尊崇和對衍聖公地位的肯定。但緊接著，話鋒一轉，指出“然國法如山，不容私廢”。針對清吏司查實的孔府諸多不法行為，皇帝最終裁定：
·衍聖公孔胤植治家不嚴，罰俸三年，責令其閉門讀書，深刻反省。
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