皇帝旨意既下，三司會審正式啟動。都察院、刑部、大理寺組成的聯合辦案堂，成為了京城新的焦點。林凡雖未直接參與審案，但他帶回的鐵證如山，以及他在朝堂上那番義正辭嚴的控訴，已然為這場審判定下了基調。一場針對工部乃至其背後勢力的“秋後算賬”，就此拉開序幕。
公堂之上，氣氛肅殺。那位在江南被林凡拿下的荊州知府，以及工部具體負責堤壩工程的郎中，成為了首批被推上前台的關鍵人物。
麵對三司官員的訊問，二人起初還試圖狡辯，將責任推給“天災異常”、“物料籌措困難”等借口。然而，當林凡提供的賬冊副本被當庭出示，上麵清晰記錄著每一筆贓款的去向、每一次分贓的參與人員時，他們的心理防線徹底崩潰。
尤其是當趙虎押送上幾名從江南秘密帶回的涉案皇商和知情胥吏，當庭對質，指認他們如何勾結官員，以次充好，克扣工款時，罪證已然形成無可辯駁的鎖鏈。
“是……是工部張侍郎暗示我等可以‘靈活處置’……”
“款項到了荊州，知府大人便要抽走三成……”
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“那些條石，都是用朽木外麵包了一層石粉冒充的……”
一句句供詞，如同冰冷的匕首，刺破了官場貪腐的黑幕，也將矛頭隱隱指向了工部侍郎以及其座師——高拱。
麵對如此不利局麵，高拱展現出了老辣政客的狠厲與果決。他並未試圖保全所有人，而是迅速采取了“斷尾求生”的策略。
就在三司會審進行得如火如荼之時，高拱突然上奏，以“失察之罪”自請處分，並主動提出將其門下那位涉嫌貪墨和可能牽連刺殺案的工部侍郎“革職查辦”，以示大公無私。他甚至暗示，此人行為狂悖，或許背著他做下了更多不軌之事。
這一手“棄車保帥”，不可謂不狠辣。既在一定程度上撇清了自己，又將所有罪責推給了那個即將成為棄子的侍郎，試圖將案件的破壞力控製在一定範圍內。
同時，高拱一係並未坐以待斃。他們利用在都察院和言官中的影響力，開始反過來尋找林凡及其派係的“問題”。有人彈劾林凡在江南“擅權專殺”，處置官員過於嚴酷；有人質疑“海事營造局”耗費巨資，卻未見實效；更有人舊事重提，將之前醫政推廣中的一些波折，歪曲為“新政擾民”的證據。一時間，彈劾林凡的奏章也多了起來，試圖營造一種“雙方皆有瑕疵”的輿論，混淆視聽。
龍椅上的皇帝，冷靜地觀察著這場朝堂混戰。他樂見林凡打擊貪腐，整頓吏治，但也絕不願看到高拱勢力被連根拔起，導致林凡一方獨大，失去製衡。
因此，對於高拱“斷尾”的奏請，皇帝順勢批準，將那位工部侍郎下獄論罪，但對高拱僅予以口頭申飭，罰俸了事。對於攻擊林凡的奏章，皇帝則大多“留中不發”，或輕描淡寫地批示“知道了”，既未深究林凡，也未嚴懲言官，維持著一種微妙的平衡。
皇帝甚至在一次召見林凡時，看似無意地提及：“林愛卿，水至清則無魚，人至察則無徒。為政之道，張弛有度。如今工部蛀蟲已除，海事、科舉等新政亦在推進，愛卿當集中精力於此，方是根本。”這番話，既是提醒，也是警告，希望林凡適可而止。
林凡何等聰明，自然聽懂了皇帝的弦外之音。他深知，在皇帝劃定的界限內，目前能取得的戰果已經達到極限。強行推動，反而可能引火燒身。
他選擇了順勢而為。不再在朝堂上窮追猛打，而是將精力轉向鞏固已有的勝利果實和推進各項新政。
·海事加速：他督促宸親王，加快“海蛟”級戰艦的建造速度，並開始著手製定新水師的編製、操典和作戰條例。來自江南商會的第一批巨額資金和物資到位，使得營造局規模不斷擴大。
·科舉定調：借著此次吏治整頓的東風，林凡再次強調選拔“通曉實務、心係民生”人才的重要性。下一屆會試將進一步擴大策論範圍和分值，已成定局，反對的聲音因工部前車之鑒而微弱了許多。
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