北京，格物院醫學所。
空氣中彌漫著酒精、草藥和一種淡淡的、類似雞蛋腐敗的怪異氣味。一間被黑絨布窗簾嚴密遮擋的實驗室內，燭火搖曳，將幾個俯身於一台奇特儀器上的人影投在牆壁上，如同皮影戲中的剪影。
那儀器主體是一個黃銅製成的圓筒，兩端鑲嵌著打磨得極其光滑的水晶透鏡，筒身配有精密的齒輪調節旋鈕——這正是格物院光學坊根據皇帝朱由檢提供的模糊原理圖，曆經數年失敗，最終試製成功的“顯微之鏡”（顯微鏡）。雖然放大倍數不過百倍，成像還有些模糊和色散，但這已然是超越時代的眼睛。
主持實驗的是醫學所主事，一位年約四旬、名叫吳有性的郎中。他原本是南方一位以治療瘟疫著稱的名醫，因思想開明、不泥古法，被格物院征召。此刻，他正小心翼翼地用一根細如發絲的銀針，從一個敞開的、已經有些發臭的傷口膿液樣本中，挑起一絲黏液，置於一片極薄的透明琉璃片（載玻片）上，蓋上另一片更薄的琉璃片（蓋玻片），然後將其固定在顯微之鏡的載物台上。
他深吸一口氣，湊近目鏡，緩緩轉動調節旋鈕。跟隨在他身邊的，除了他的年輕助手，還有一位來自講武堂軍醫司的官員，以及一位被特許進入、臉色依舊有些蒼白的傷兵——他手臂上的創傷曾嚴重潰爛，高燒不退，幾乎被軍中醫官判了死刑，卻在一係列新的處置方法下奇跡般好轉。
“看到了……看到了！”吳有性的聲音因激動而有些顫抖，他猛地抬起頭，眼中滿是震撼與難以置信，“真的有！無數細小的、球狀的、杆狀的‘微蟲’！它們在動！在膿液裡遊弋、翻滾！數量之多，如同恒河沙數！”
軍醫司官員和那傷兵也迫不及待地輪流上前觀看。當那前所未見的、充滿活動的微小生命世界呈現在眼前時，軍醫官倒吸一口涼氣，而傷兵則嚇得差點後退一步，喃喃道：“俺的娘咧……原來……原來當初俺胳膊裡，就是這些鬼東西在作祟……”
吳有性直起身，因長時間保持一個姿勢而有些眩暈，但他的思路卻異常清晰，他轉向軍醫司官員，語氣斬釘截鐵：“王大人！現在可以確定了！傷口之所以會紅腫、發熱、流膿，乃至引發全身高熱（敗血症），並非完全是‘風邪’、‘火毒’入體，更是因為這些肉眼看不見的‘微蟲’——我們暫稱之為‘病菌’——侵入人體，在其中大量滋生、破壞所致！”
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他指著旁邊一個炭爐上煮沸著的水壺，以及幾個浸泡在濃烈燒酒（酒精）中的手術器械：“而之前我們試驗的，用沸水反複衝洗傷口，用這高度燒酒擦拭創麵，乃至將所有接觸傷口的布條、器械都用沸水或蒸汽處理過的方法，之所以能顯著降低潰爛和高熱，正是因為高溫和這烈酒，能殺死或抑製這些‘病菌’！”
這就是朱由檢憑借超越時代的記憶，向格物院醫學所暗示的“病菌說”與“高溫消毒法”的雛形。經過無數次摸索和對照實驗（甚至不惜用動物和死刑犯創傷感染模型），吳有性團隊終於初步驗證了這一理論的正確性。
“陛下真乃天縱聖明！”吳有性由衷感歎，即便皇帝隻是給出了模糊的方向，“此說若真能確立，實乃醫學千年未有之突破！”
講武堂軍醫司的王大人激動得臉色通紅。他太清楚這意味著什麼了。以往戰爭中，直接陣亡的士兵往往隻有三四成，更多的傷亡來自於戰後的傷口感染和軍營瘟疫！若此法推廣，不知能挽救多少精銳將士的性命！
“吳主事！我立刻返回講武堂，稟明上官，請求在全軍推廣此法！所有軍醫、醫護兵必須學習！所有傷兵營必須建立‘消毒’規程！”王大人幾乎是吼著說道。
很快，一套基於“病菌說”和“高溫消毒法”的《新式戰傷救治與軍營衛生條令》草案，被迅速擬定，並通過電報發往各大新軍駐地以及遙遠的澳洲新金陵鎮。
數周後，天津衛，一處新軍演練基地。
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