孫祖壽因為違反上司命令，在1627年被免官歸田。
天啟年間，孫祖壽任薊遼鎮參將，當時武備鬆弛，人心渙散，刑罰不嚴，號令難以執行。
孫祖壽上任之後，革除陳規陋習，禁止請客送禮，謝絕說人情、走後門，他還懸下賞格，嚴明法度：自副將、參將以下，作戰不勝，革職不用！
這些舉措讓孫承宗讚賞不已，這次孫承宗被重新啟用，他便推薦孫祖壽做了見習副總兵（乾聖皇帝安排的見習生，雖然說你以前是個總兵，但是現在你一來就當個總兵還是有點不合適，整個見習就好多了不是？也不駁了孫承宗的麵子。）駐守三屯營，新興的大明真的很需要這樣的將才啊。
乾聖皇帝也仔細看過了孫祖壽的履曆和他之前對於軍隊的整頓，原來，謝絕說人情，走後門也是可以明令禁止拿到台麵上來說的啊！自己有些保守了不是?他便把這些條款也加入到了紀檢委和兵部的處罰條例之中。
孫祖壽道：“奉孫承宗都督之命，這次點卯就是為了發放這個月的月餉，還有就是整頓軍務，把不合格的、年紀大的清退出去。現在取消了軍戶製度，完全采用招募製度，至於朝廷以前的欠餉，你們也不必擔心，朝廷會補齊的。”
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下麵的士兵一陣騷動，被一旁的軍官一陣喝罵後安靜下來。
孫祖壽接著道：“四十歲以上的老兵這次就要被辭退了，你們可以種田。這田租交六分給朝廷，自己留四分，取消人頭稅，按畝起科，每個管隊會按照一人十畝的標準重新劃分田地給你種，這些田以後都不得買賣，你們隻有使用權，新開墾的新田也是歸屬皇上所有，按照前麵所說的都是一樣的上稅，隻是說免稅一年，也就是免稅二次租，都聽懂了沒有？”
此話一出，那些原本絕望的老兵一下撲倒在地上高喊：“吾皇萬歲萬萬歲！”
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