一組負責在外圍警戒，防止外界乾擾。一切準備就緒後，牟斌決定在深夜行動——此時大部分人都已入睡，行動更為隱蔽。
深夜，月黑風高，天空中沒有一絲星光，隻有陣陣寒風呼嘯而過。錦衣衛士兵如同鬼魅般潛入宅院周圍，腳步輕盈，沒有發出一點聲響。他們迅速占據有利位置，將宅院團團圍住，手中的繡春刀出鞘，寒光閃閃。牟斌親自坐鎮指揮，他躲在不遠處的一棵大樹後，觀察著宅院的動靜，等待最佳的抓捕時機。
片刻之後，牟斌看到宅院的窗戶中透出燭光，判斷裡麵的人正在會麵，便抬手示意。一名士兵會意，悄悄靠近宅院的大門，用特製的工具輕輕撬開了門鎖。“衝！”牟斌一聲低喝，士兵們破門而入，衝入宅院之中。宅院內的間諜毫無防備，被打了個措手不及。一名間諜剛想拿起桌上的密信燒毀，便被錦衣衛士兵一腳踹倒在地，密信被成功繳獲。
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經過一番短暫的搏鬥，宅院內的十餘名間諜全部被抓獲，沒有一人逃脫。同時，錦衣衛士兵還在宅院內繳獲了大量的密信、圖紙與暗號手冊。這些密信用特殊的墨水書寫，需要用特定的藥水浸泡才能顯現字跡；圖紙中包含了大明的蒸汽機槍製造技術、迫擊炮設計圖紙、邊境軍事部署圖等重要情報；暗號手冊則記錄了間諜之間的聯絡暗號與密碼規則。牟斌拿起一份蒸汽機槍的製造圖紙，臉色鐵青，怒火中燒——這些核心技術，是大明將士用鮮血與生命守護的機密，如今卻被間諜泄露給了歐洲。
在確鑿的證據麵前，王慶無從抵賴，隻能如實交代。通過他的供詞，錦衣衛終於摸清了這張間諜網的全貌：整個間諜網以王慶為核心，輻射至京城、南京、廣州等多個重要城市，包含二十餘名朝廷官員、五十餘名軍工工坊的工匠與三百餘名平民。這些人中，有的是被歐洲人的巨額賄賂所誘惑，迷失了心智；有的是因為欠了歐洲商人的債務，被抓住了把柄，被迫就範；還有的是因為對朝廷的政策不滿，心懷怨恨，主動投靠了歐洲，想要借助歐洲的力量顛覆朝廷。
王慶還交代，歐洲間諜網的目的不僅僅是竊取情報，還計劃在適當的時候，配合歐洲軍隊的進攻，在大明內部製造混亂——散布謠言動搖軍心、煽動百姓叛亂、破壞軍工工坊等。牟斌聽完王慶的交代，心中更為震驚，他意識到，這張間諜網的危害遠比想象中更為嚴重，必須儘快將所有間諜抓捕歸案，才能消除隱患。
掌握了完整的間諜名單與證據後，牟斌不敢耽擱，立刻整理好相關材料，連夜前往皇宮，向正德帝上奏。此時已是淩晨，皇宮內一片寂靜，隻有巡邏的侍衛在走動。牟斌在宮門外等候了半個時辰，才等到宮門打開。他快步走進皇宮，來到正德帝的寢宮之外，請求覲見。
正德帝得知牟斌深夜覲見，知道必有緊急之事，便立刻召見了他。牟斌將間諜網的情況詳細向正德帝彙報，同時呈上了繳獲的密信、圖紙與暗號手冊。正德帝看完材料，龍顏大怒，猛地一拍桌子，桌上的茶杯被震落在地，摔得粉碎。“大膽奸賊，竟敢勾結外敵，出賣朝廷！”正德帝怒聲喝道，臉色鐵青，“這些人食君之祿，卻不忠君之事，竟然為了一己之私，背叛家國，罪該萬死！”
他看向牟斌，語氣嚴厲地說道：“牟斌，朕命你即刻展開大規模抓捕，將所有間諜一網打儘，絕不姑息！無論涉及到誰，哪怕是王公貴族，都要一查到底，依法處置！”“臣遵旨！”牟斌領命而去，眼中閃過一絲堅定。離開皇宮後，他立刻返回錦衣衛衙門，下達命令，讓各地的錦衣衛同時行動，抓捕間諜。
一時間，京城及各地都響起了錦衣衛抓捕間諜的動靜。在京城，錦衣衛士兵手持聖旨，直奔間諜的家中與任職之地。有的間諜還在睡夢中，便被破門而入的錦衣衛士兵驚醒，隨後被戴上枷鎖，押解回衙門；有的間諜在任職之地被抓捕，同僚們無不震驚，紛紛議論紛紛。在抓捕過程中，部分間諜負隅頑抗，拿出武器與錦衣衛士兵發生了衝突。
一名偽裝成商人的間諜，在店鋪內與錦衣衛士兵展開搏鬥，他手持一把短刀，身手矯健，卻終究不敵訓練有素的錦衣衛士兵，被當場製服。還有一名軍工工坊的工匠，試圖點燃工坊內的火藥，與錦衣衛士兵同歸於儘，幸好被錦衣衛士兵及時發現，撲滅了火焰，將其抓獲。錦衣衛士兵訓練有素，戰鬥力極強，很快便將所有反抗的間諜製服。
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