絕大多數科學家追求的“終極理論”都是指“終極的起點”。因為宇宙之大，未知無儘，不可能有“完成的理論”。牛頓曾經說過：“自然哲學的任務，是從現象中求論證，從結果中求原因，直到我們求得最初的原因為止。”
溫伯格說：“終極理論隻能在一個意義上說是終極———它把某一種科學探索引向終點：那是一種古老的探索，探索那些不可能有更深層原理來解釋的原理。”這個“不可能有更深層原理來解釋的原理”就是“起點”。
霍金過去也是追求“終極的起點”，他曾宣稱：存在一種可以把所有自然規律都以一個單一的、優美的數學模型表示出來的“終極理論”，也許簡潔到在一件T恤衫上就能打印出來。
霍金又放棄了這一追求，理由是“一個物理理論乃是一個數學模型。因此如果有數學命題不能證明的話，那就有物理問題不能預測……我很高興我們尋求知識的努力永遠沒有終點，我們始終都有獲得新發現的挑戰。”這反映出霍金追求的目標從“終極的起點”轉向了“終極的完成”。
霍金對“終極理論”的理念上產生反轉，使他自己陷入自相矛盾之中，最終滑向不可能實現的“終極完成”式的“終極理論”。
時間與空間是相聯還是撕裂：牛頓認為定律不是孤立的，所有定律之間都有因果關係，因此隻要找出一個核心定律（最初因），就能從它推導出所有定律。第一層先推導出數個外圍定律；第二層，每個外圍定律又推導出數個定律；第三層，第四層……最後就把所有實驗定律一一推導出來，而實驗定律又可以推導出宇宙萬物。這就是牛頓的終極理論，也是愛因斯坦“用單純的演繹方法”建立世界體係的構想。
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這裡內層定律是“原因”，被推導出來的外層定律是“結果”，定律之間是因果相連。實際上科學並不是從核心開始的，而是從外層的實驗向內層核心尋找。通過實驗可以找出實驗定律，但是再向內層找定律，就無法采用實驗方法，隻能從實驗定律（結果）向內層找它的根定律（原因），這就是牛頓的“從結果中求原因”。這是反向推理求根的過程：數個實驗定律歸根於一個第三層定律，數個第三層定律又歸根於一個第二層定律，直到最後全部回歸到核心定律（最初因），這就是“直到我們求得最初的原因為止”。從最初因開始推理所以稱“起點”；推理過程稱“演繹”。
在他的終極理論構想中，各種定律從核心定律向外一層一層推理，各種定律分別在不同層次上。
而霍金及許多科學家要把不同層次的定律合成一組數學式，這顯然是辦不到的，不同層次的問題根本不可能合在一起。“核心定律”向外像樹那樣一枝又一枝分出支節，當分解到物理定律時，已變的千差萬別，毫不相連，這就導致定律無法在下層直接合並。如：量子化定律與引力定律是二個分支無法直接合並，然而霍金卻要把這兩個定律直接合並，建立“量子—引力”理論。
霍金認為終極理論最大的困難是無法將萬有引力與另外三種力合並，其實根本不必合並，因為按照牛頓方法隻要沿著分支找主乾，就能將所有分支定律統一。
霍金是直接把定律合並，而牛頓是把定律因果排序找最初因。這是兩種完全不同的方法，反映了二者終極理論構造不同。
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