就這樣開始了長達兩個月的休養，宮中禦醫日夜值守，輪番診治、煎藥、施針，高拱與張居正等閣臣也每日入宮，探望病情、詢問情況，心中充滿擔憂。
或許是上天垂憐，或許是藥方起到些許作用，經過兩個月休養，隆慶帝的病情竟然暫時穩定下來。不再頻繁頭暈目眩，意識也漸漸清晰一些，虛汗不止的症狀也有所緩解，甚至能夠偶爾坐起身來，簡單的與身邊的人說幾句話。
朝野得知隆慶帝病情穩定的消息後，皆鬆了一口氣。高拱更是欣喜不已，他以為，隻要隆慶帝繼續好生休養，或許病情還能進一步好轉，或許還能重新臨朝理政，繼續帶領大明走向繁榮。
可萬萬沒有想到，這僅僅是短暫平靜，一場更大危機正在悄然醞釀。
就在隆慶帝病情暫時穩定後不久，他的右手腕突然生出一個惡瘡。起初，隻是一個小小紅點，伴隨著輕微瘙癢疼痛，隆慶帝並未放在心上。可沒過幾日，惡瘡便迅速惡化，紅腫、化膿，疼痛難忍，並且，久久不能愈合，膿液不斷滲出，散發著刺鼻惡臭，即便禦醫用儘各種方法，塗抹藥膏、服用藥方，也始終無法控製惡化，反而越來越嚴重。
惡瘡疼痛，加上原本的“色癆”，讓隆慶帝陷入無儘痛苦之中。他日夜哀嚎，痛不欲生，原本有所好轉的精神狀態，再次變得萎靡不振，意識也漸漸模糊，甚至有時候還會出現胡言亂語的情況。宮中禦醫束手無策，隻能不停為隆慶帝塗抹止痛藥膏、開具止痛藥方，勉強緩解痛苦，卻始終無法治愈手腕惡瘡。
高拱看到隆慶帝痛苦的模樣，心中酸澀不已。每日入宮，都會親自查看隆慶帝手腕上的惡瘡，詢問禦醫的診治情況，每當看到那化膿潰爛、散發惡臭的惡瘡，看到隆慶帝痛苦的模樣，他的心就如被刀割一般，疼痛不已。可他卻無能為力，隻能不停安慰隆慶帝，讓他堅持下去，讓他相信一定會找到治愈方法。
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隆慶帝的身體，在惡瘡與“色癆”的雙重折磨下，日漸衰弱。日漸消瘦，形銷骨立，原本的帝王威儀，早已蕩然無存，隻剩下無儘的痛苦絕望。變得沉默寡言，不再像往日那般沉迷酒色，也不再像往日那般意氣風發，常常獨自躺在床上，目光呆滯的望著天花板。
可這一切，都已經晚了。時光無法倒流，錯誤無法挽回，他親手摧毀了自己的身體，也親手為大明的未來埋下隱患。他隻能默默承受著病痛折磨，等待著生命終結。至隆慶六年二月末，隆慶帝的病情，終於有了一絲微弱好轉。
手腕上的惡瘡，雖然依舊沒有愈合，膿液依舊在滲出，但疼痛卻稍稍緩解一些，意識也變得清晰許多。或許是他心中還存有一絲執念，或許是想要再最後看一看，自己的朝堂，自己的臣子，隆慶帝突然提出想要臨朝理政，想要再最後，看一看江山社稷。
高拱得知消息後欣喜不已，連忙安排讓隆慶帝勉強臨朝一次。隆慶帝的身體依舊十分虛弱，根本無法長時間臨朝，隻能勉強支撐著，與大臣見一麵，了解一下朝堂近況。因此，他特意囑咐，此次臨朝切勿多言，切勿提及讓隆慶帝煩心的事情，以免刺激，加重病情。
臨朝之日，紫禁城太和殿，氣氛凝重。朝臣身著朝服整齊站列，目光之中充滿擔憂。隆慶帝被小心翼翼攙扶著，他身著龍袍，卻依舊無法掩蓋形銷骨立的模樣，麵色青黑，被衣袖遮蔽住的右手腕上，纏著厚厚紗布，紗布之上，還隱隱滲出一絲血跡與膿液。每走一步都顯得十分艱難，仿佛下一秒就會倒下。
大臣看到隆慶帝這般模樣，心中皆充滿酸澀，紛紛低頭，不去直視隆慶帝的目光。隆慶帝緩緩走到龍椅之上艱難坐下，他微微閉上眼睛，休息片刻，才緩緩睜開眼睛，目光疲憊的掃過殿內大臣，聲音微弱，語氣沙啞的說道：“眾卿……平身。”
“謝陛下！”大臣們齊聲跪拜，聲音低沉，隨後紛紛起身，整齊站在殿內，沉默不語。
此次臨朝，十分短暫。大臣按照高拱囑咐，簡單稟報近期朝政情況，沒有提及任何讓隆慶帝煩心的事情，也沒有提出任何複雜奏請。隆慶帝隻是靜靜聽著，偶爾微微點一點頭，沒有發表任何意見，也沒有提出任何疑問，他的目光始終顯得十分疲憊，仿佛用儘全身力氣。
短短兩刻後，隆慶帝便支撐不住，他微微皺眉，臉上露出痛苦神色，聲音微弱的說道：
“眾卿……無事……便退朝吧……”
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