秦王教令既下，籌建“崇文館”與四州州學之事，便由尚書左仆射崔胤總領，杜讓能協理，緊鑼密鼓地鋪展開來。然而，事情甫一開始，便遇到了預料之中的阻力，這阻力首先便體現在長安“崇文館”的館址選擇上。
按照崔胤與杜讓能最初的規劃，為示隆重，並便於管理，擬選址於皇城東南隅，原國子監附近一處官地。此地臨近宮署，環境清幽，本是上佳之選。然而，消息傳出，朝中一些出身世家或與舊族關係密切的官員，便以“臨近宮禁，恐生徒喧嘩，有失體統”、“國子監乃國家養士重地，新學混雜，恐非所宜”等理由，或明或暗地表示反對。更有甚者，私下串聯，意圖推動將館址定在更偏遠、條件更差的地點。
崔胤將爭議呈報至承運殿。李鐵崖聽罷，冷笑一聲：“體統？孤要的是為國育才，不是養一群清談客！靠近宮禁怎麼了？讓未來的棟梁早早感受朝廷氣象，有何不可？國子監？”他語氣轉厲，“國子監若能廣育英才，不拘門第，孤又何必另起爐灶？此事不必再議！”
他直接召來將作大匠，親自圈定館址——不僅仍在皇城東南，而且麵積比原議更大，將旁邊一片前朝廢棄的宗正寺別院也劃了進去。“此地甚好，屋舍雖舊，根基猶在，修繕擴建即可。著將作監即刻動工，按照崇文館所需，設計講堂、齋舍、藏書樓、射圃、膳堂，務求寬敞實用。工期，限三月之內，完成主體。錢糧物料，優先撥付。有延誤者，嚴懲不貸！”
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秦王乾綱獨斷，選址風波戛然而止。將作監不敢怠慢，立即征調工匠、民夫數千，冒著春寒，日夜趕工。原本略顯荒僻的東南隅，頓時成了長安城中最忙碌的工地之一，夯土聲、鋸木聲、號子聲，響徹雲霄，也敲打在許多舊族子弟的心頭。
館址既定，更關鍵的章程細則擬定，則考驗著崔胤、杜讓能等人的智慧與決心。如何在打破門閥壟斷的同時，儘可能減少阻力，確保新學能切實推行？
承運殿旁的政事堂內，燈火常常徹夜不熄。崔胤、杜讓能召集了部分出身相對寒微、支持新政的官員，以及從民間征辟的幾位有名望的儒士、算學家，反複商討。
“生徒資格，乃第一要務。”杜讓能執筆記錄，“王爺明示‘無論門第，唯才是舉’。然才如何舉？若完全不論出身，隻憑考試，恐世家子弟自幼熏陶，依然占優。且寒門子弟，求學無門，如何能與他們同場較技？”
一位來自同州的寒士出身官員提議：“下官以為，可分途並進。其一，可由州縣薦舉，但須嚴格名額與標準，注重實學、品行，而非虛名。其二，可設‘特科’，如明算、明法、明工等，專考實用技藝，不同經義文章，或可讓有一技之長者脫穎而出。其三，王爺親軍、各鎮軍中，可選拔聰慧有功之低級軍校、士卒子弟入學，此輩忠誠可靠，且多知實務。”
崔胤點頭：“此議甚好。可規定，崇文館每年招收生徒二百人。其中，一百人由關中、河中、河陽、昭義、洛陽、河套等各州按戶口比例薦舉，薦舉時需附被薦者‘家狀’（履曆）、‘藝業’（專長）及州縣考語，並需有至少兩名非親屬官員作保，嚴防濫竽充數。另五十人，通過‘特科’考試選拔，分算學、律學、地理堪輿、農工格物等科，由館中博士出題考核。最後五十人，由王府及各鎮軍推薦忠勇將士子弟或軍中俊才。如此，三途並進，或可兼顧。”
“課程設置，亦當革新。”一位被征辟的老儒緩緩道，他雖通經史，但對實學亦不排斥，“儒家經義，修身治國之本，不可偏廢，當為必修。然可側重《春秋》、《左傳》之微言大義，《史記》、《漢書》之治亂興衰，《論語》、《孟子》之仁政思想，弱化繁瑣章句訓詁。此外，律學、算學、地理（需涵蓋山川險要、風俗物產）、農桑要術、水利概要，乃至基礎兵略、公文寫作，皆應設為常科。可分經義、實務兩齋，各有側重。”
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