營養補充品雖有改善身體機能的效果，但它們無法完全取代天然食物，因為天然食物具有綜合的營養成分，且含有膳食纖維，可以幫助預防便秘、心臟病與糖尿病產生，加上天然食物含有營養補充品所沒有的植物性化學物質，有助於防範慢性疾病產生。
補充不當會產生不良的副作用。每天攝取維生素A超過3000毫克，將損傷肝臟，還會導致嬰兒先天性缺陷；過量補維生素E，雖能降低缺血性心臟病和缺血性心肌梗塞的發病危險，但也會加大腦出血的危險性。補鈣若超過了血液的溶解能力，便會在人體其他組織中沉積，若沉積在心臟會引起傳導障礙，導致心律失常。
另外，許多女性在月經過後，會燉四物湯、生化湯調養身體。四物湯具有補血、活血的作用，生化湯可以幫助月經徹底地排出，達到活血化瘀的效果。但如果補得太過頭反而出現長青春痘、口乾舌燥、焦煩不安、失眠等症狀。
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