給京房，讓他停止年終奏事的請求。京房更加恐懼。
秋季，京房出發到新豐，托驛站上密封奏事說：“我先前在六月中上言《遁卦》的應驗情況不符，占法說：‘有道術的人剛離去，天氣就會寒冷，洪水為災。’到了七月，果然出現了洪水。
我的弟子姚平對我說：‘京房可以說是知道道術，但不能說是篤信道術。京房談論災異，沒有不應驗的。洪水已經出現，有道術的人應當被驅逐而死，還有什麼可說的！’我說：‘陛下極其仁愛，對待我尤其優厚，即使因進言而死，我還要進言。’
姚平又說：‘京房可以說是小忠，不能說是大忠。從前秦朝趙高專權，有個叫正先的人，譏刺趙高而被處死，趙高的威勢從此形成，所以秦朝的混亂，是正先促成的。’
如今我得以出任外郡太守，自己請求為國效功，恐怕還沒來得及效功就被處死，請陛下不要讓我應驗洪水的災異，像正先那樣死去，被姚平所譏笑。”
京房到了陝縣，又上密封奏事說：“我先前建議讓任良試任刺史，我得以留在朝中。議事的人知道這樣對他們自身不利，我不可能被他們蒙蔽，所以說‘讓弟子試用老師不如任用老師本人’。
我擔任刺史，又要奏事，所以他們又說‘擔任刺史，恐怕太守不能與他同心協力，不如任用為太守’。這就是他們想要隔絕我的辦法。陛下不違背他們的話而聽從了，這是蒙氣不能消散、太陽無光的原因。
我離京城越來越遠，太陽被遮蔽的跡象更加嚴重，希望陛下不要因為讓我返回京城有困難而輕易違背天意。邪說雖然能暫時安定，天氣必定會發生變化，所以人可以被欺騙，天卻不能被欺騙，希望陛下明察。”
京房離開京城一個多月後，竟然被征召下獄。當初，淮陽憲王的舅舅張博，機巧而沒有品行，多次向淮陽王求取金錢，想替淮陽王謀求入朝的機會。
張博跟隨京房學習，把女兒嫁給了京房。京房每次朝見元帝後，退朝後總是對張博講述朝中的情況。張博於是記下京房所說的機密話語，讓京房替淮陽王起草請求入朝的奏章，都帶給淮陽王，作為憑證。
石顯知道了這件事，告發京房與張博通謀，誹謗朝政，把罪過歸於天子，貽誤諸侯王。京房和張博全都被捕下獄，判處死刑，屍體棄市，妻子兒女流放到邊境。
鄭弘因與京房交好而受到牽連，被免為庶人。
禦史中丞陳鹹多次詆毀石顯，時間久了，因與槐裡令朱雲交好，泄露宮中機密，被石顯暗中偵察得知，陳鹹與朱雲都被捕下獄，處以髡鉗之刑，罰做築城的苦役。
石顯的威勢和權力日益興盛，公卿以下的官員都畏懼石顯，不敢邁步冒犯。石顯與中書仆射牢梁、少府五鹿充宗結為黨羽，所有依附他們的人都得到寵信和官位，民間歌唱說：“牢邪！石邪！五鹿客邪！印何累累，綬何若若邪！”
石顯內心自知專權擅政，擔心天子一旦任用左右的耳目來離間自己，於是時常表現出誠意，取得一個憑證來證明自己。
石顯曾奉命到各官署征調物資，他事先稟告元帝說：“恐怕等到回來時宮門已經關閉，請求允許我假稱詔命讓官吏開門。”元帝答應了他。
石顯故意在夜裡回來，聲稱奉詔命開門進入宮中。後來果然有人上書告發“石顯擅自發號施令，假傳詔書打開宮門”，天子聽說後，笑著把上書拿給石顯看。
石顯於是流淚說：“陛下過分偏愛小臣，把事務委托給我，群臣無不嫉妒，想陷害我，類似這樣的事情不止一件，隻有明主才能了解我。
愚臣地位微賤，實在不能以一人之身讓萬眾稱心如意，承受天下人的怨恨。我願意歸還中樞機要的職位，到後宮做灑掃的差役，死也沒有遺憾。希望陛下哀憐我，加以裁決，以此保全小臣。”
天子認為他說得對而憐憫他，多次慰勞勉勵石顯，給予豐厚的賞賜，賞賜及賄賂累計達一萬萬錢。
當初，石顯聽說眾人議論紛紛，說自己害死了前將軍蕭望之，怕天下的學士譏諷自己，因諫大夫貢禹通曉經術、有節操，便派人向他表達心意，深相交結，並向天子推薦貢禹，使他曆任九卿，對他的禮遇非常周到。
議論的人於是有稱讚石顯的，認為他不曾妒忌誣陷蕭望之。石顯設下詭詐來為自己解脫，取得君主的信任，都是這類做法。
荀悅評論說：奸佞之臣迷惑君主實在太厲害了，所以孔子說：“疏遠奸佞之人。”不隻是不用他們而已，還要遠離並斷絕與他們的聯係，堵塞他們的源頭，這是極致的警戒啊！
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