《霧都孤兒》像《荒涼山莊》那樣的後期作品一樣充滿複雜的暗示、關聯和預言(在19世紀劇情鬆散寬泛、往往需要連載的小說中，緊湊的情節是極其罕見的)。狄更斯研究家伯頓·M.惠勒舉出了一些例子，證明在創作連載小說的過程中，那時的作家采用的是更加隨心所欲的情節編排原則，因為他們無法按照自己的意願修改已經發表的內容。惠勒指出，狄更斯會在前文埋下伏筆，以便後來利用，比如，在奧利弗來到費金巢穴後的第一個早晨，這個買賣贓物的老東西拿出一件小飾品，它是“很小很小的東西，掌心裡就放得下。那上麵似乎刻有極細小的紋樣。老猶太……仔仔細細地觀察了半天”(《霧都孤兒》第9章)。後來我們再也沒有見過這個小飾品，狄更斯很可能是先在這裡埋下伏筆，以便後來需要的時候用它演繹劇情——或許他會說這是已故的阿格尼絲的珠寶。
《霧都孤兒》中的創作自主性還體現在插畫師方麵。插畫師對這部小說助益良多，以至於在年輕的亨利·詹姆斯的記憶中，這本書“更像是克魯克香克的，而不是狄更斯的，因為書中的插圖實在太逼真了”。事實上，狄更斯過世後，晚年的喬治·克魯克香克確實聲稱《霧都孤兒》都是他的點子，儘管這話並不怎麼可靠。不過，克魯克香克的確發揮了關鍵作用。一方麵，正如波德萊爾描述的那樣，克魯克香克特色鮮明的強烈畫風呈現出的戲劇效果同狄更斯的文字十分吻合。“他畫筆下的人物往往表情誇張，動作劇烈，活像啞劇演員在演戲一樣。”另一方麵，他的畫風也透著一股陰沉和譏諷的味道。“他已經習慣了怪誕的風格。”狄更斯有成稿在手的時候，克魯克香克會拿到每月要連載的章節，據此繪製插圖。但狄更斯有時候隻能給他一段簡短的描述文字，或者口頭解釋兩句。在《奧利弗在睡覺嗎？》裡，約翰·薩瑟蘭做出了一個巧妙而可信的推斷：或許正是這種工作方式導致了第三十四章中看似無法解釋的怪異一幕——奧利弗在窗邊打瞌睡，夢見自己回到了費金的巢穴，從噩夢中驚醒後，他發現費金和蒙克斯真的就站在窗外盯著自己。這幅《霧都孤兒》中的著名插圖被克魯克香克命名為《蒙克斯和老猶太》。但這兩人後來莫名其妙地消失了，無跡可尋，仿佛從未真實現身一樣。薩瑟蘭認為，在動筆創作這一幕之前，“狄更斯設想了他們會對奧利弗實施綁架或者謀殺，於是及時囑咐克魯克香克提前繪製‘窗邊的壞蛋’的插圖，為小說中的場景做好準備”。但狄更斯很快改變了主意，插圖卻來不及更換了，隻好將這一幕描寫成奧利弗的幻覺。
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有趣的是，根據薩瑟蘭的理論，小說連載期間著繪者的一次普通的配合失誤，竟然增加了作品的複雜性，使其可以從象征性或心理學角度加以解讀。換言之，這看似莫名其妙的一幕折射出這樣一個問題：在心靈受創之後，奧利弗是否可以擺脫恐懼，重新生活？事實上，這或許並不是“失誤”，而是有意為之的結果。在這個問題上，理查德·馬克斯韋爾早有覺察。他曾評論說，克魯克香克對狄更斯作品的圖像闡釋“具有獨特的優勢，能為讀者和作者呈現出新的可能性，也能參與他所闡釋的作品的創作”。比如，馬克斯韋爾發現，狄更斯接納了克魯克香克在插圖《奧利弗被介紹給可敬的老紳士》(《霧都孤兒》第8章)中的建議，在緊接著的一章中將其寫進了小說裡。在這幅插圖中，克魯克香克在壁爐上方畫了一張狄更斯並未提及的大圖，圖中描繪了絞架上被絞死的三個罪犯，而且還在構圖上做了頗有道德說教意味的設計：奧利弗手中裝滿財物的手帕，“逮不著”脖子上纏繞的方巾，費金頭上包裹的方巾，還有牆上的三個索套——這四者剛好處在同一條斜線之上，背景中還有一大堆掛在曬衣架上的偷來的手帕。這條通往絞架的斜線象征了奧利弗即將踏上的危險道路。受到這一插圖的啟發，狄更斯在第九章的費金獨白中提到了絞刑。那天早上吊死的人明顯受他雇用卻被他告發，在他看來，他們“真是好樣的”。“五個人排成一行被絞死”呼應了克魯克香克的插圖，也暗示了費金的年輕手下可能的結局。但是，在彌漫著濃烈煙酒味的汙濁空氣中，這群孩子選擇自我欺騙，不去理會自己的宿命。
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