業的人不能當警官。所以對於保密局介紹去的人，非經他親自批準，不派工作，實際上等於拒絕。但蔣介石雖把這個警察組織交給唐縱，但在重要人事上仍要加以控製，特別是一些大城市的警察局長，都得由他親自決定。因此又造成另一種情況：鄭介民和毛人鳳既不便越過唐縱去請蔣介石批準；而唐縱也不會為保密局去爭取。結果，保密局要在警察係統安插人，更加不順手了。
抗戰勝利以後，各大城市的警察局長，都由蔣介石親自派出，上海給了宣鐵吾，北平給了陳卓，天津給了毛文佐，南京給了黃珍吾。本來，照戴笠的暗中安排，天津要安插李漢元，但這個在天津租界為外國人當了10多年奴才的“天津通”、老“軍統”，結果隻好屈居毛文佐之下，當了個副局長。南京的警察廳長一職，原本是戴笠留給任建鵬的。在南京撤退時，任建鵬擔任首都警察廳保警總隊長，帶著一批武裝保安警察向重慶逃跑時，把首都警察廳的印信帶在身邊，早已野心勃勃。到重慶後，他改任內政部警察總隊長。由於有戴笠撐腰，以為勝利一來，首都警察廳長非他莫屬。豈知人算不如天算，蔣介石把這個位子給了別人，他自己隻弄到一個漢口警察局長。以後北平的陳卓走了。憲兵司令張鎮又推薦他的參謀長湯永成去接充，戴笠派去的副局長祝維屏也沒有推上去。一直到1948年，幾個大城市的警察局長，才慢慢落到軍統的手上，先是天津歸了李漢元，北平歸了楊清植，上海在解放前給了毛森。因此毛人鳳常埋怨唐縱，說“唐先生隻會向家裡(指軍統)要東西，要去了馬台街的房子，要去了不少的汽車，要去了中美所的刑事實驗室全部器材，就是不肯要人!”特別是以後唐兼了國防部保安事務局長之後，也隻挑了趙世瑞等幾個人去工作，更加深了軍統老特務的反感。
保密局所控製的第二個公開的機關，是交通部全國交通警察總局，先後由吉章簡、周偉龍、馬誌超任總局長。這個局的成員，大都是原來軍委會水陸交通統一稽查處和軍委會“別動軍”司令部及“忠義救國軍”的人馬，基本上還接受保密局的領導。當時，幾條鐵路的警務處長，如京滬、滬杭甬的王兆槐，平漢的朱若愚，津浦的吳安之，隴海的程一鳴，膠濟的賀元，粵漢的張輔邦，湘桂的史銘，滇越的田動雲，都是軍統老特務。公路方麵，公路總局之下的各地公路局的警衛稽查組和運輸處的警稽室，也都由“軍統老特務控製。交通警察總局的20多個交通警察總隊，也全是由原屬軍統指揮的特務武裝部隊改編而成的。
按照過去軍統的傳統，公開機關國防部第二廳，也應由保密局控製。這在鄭介民以保密局長兼第二廳長的時期，還不成問題。後來鄭被免去保密局長和第二廳廳長兼職，由副廳長侯騰升任廳長後，便不願受保密局的控製。侯還想把原來在第二廳的軍統特務排擠出去，一手把持軍事情報，而讓保密局專搞黨政情報，分庭抗禮。毛人鳳因為自知在軍事情報方麵搶不過第二廳，但又不肯放手，隻好暗中指使留在該廳的軍統成員，繼續與保密局保持工作關係，並設法與侯騰搗鬼。一直到逃台之前，雙方都鉤心鬥角，互相爭寵。
保密局控製得最多的是各地的稽查處，這是軍統從抗戰勝利後便首先搶到的公開單位，如上海淞滬警備司令部稽查處長程一鳴、南京衛戍司令部稽查處長何龍慶、北平警備司令部稽查部倪超凡、天津警備司令部稽查處長陳仙洲等等，都是戴笠親自安排的，以後也一直掌握在保密局手中。至於原來大後方的一些地區，如重慶、成都、西安、蘭州等地的稽查處，在保密局時期，也一直沒有放過手。另外，各大城市的偵緝大隊或刑警處，也都掌握在保密局手中。保密局在各地掌握了這兩種公開特務機關，不但對逮捕、搜查、監禁等方麵的活動，可用“合法”的麵目從事，得到很大的方便。
另外，在保密局控製下的，還有兵工署的稽查處。這個處成立於抗戰初期，原來叫警衛稽查處。抗戰勝利後仍舊保留下來，改名“稽查處”。保密局內部則稱之為兵工稽查處，以區別於各地警備司令部的稽查處。這個處的成立，是專門為了防止共產黨在各兵工廠活動和鎮壓各兵工廠工人的。國民黨政府又把各兵工廠工人列為現役軍人，不準組織工會。各兵工廠都設有警稽組和警衛大隊，他們對待兵工廠工人，也動輒是“軍法從事”。抗戰期間，這個處的處長是張師，勝利後是廖宗澤，這兩人都是投入軍統的間諜。
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