逃亡叛亂的，隻要後來歸順，那就恢複他們的爵位，並不會誅殺他們。’如今如果你束手歸順，再派隗恂的弟弟到朝廷來，那麼你的爵位和俸祿都可以保全，有浩大的福氣！現在我已年近四十，在軍中已經待了十年，早就厭倦了浮華的言辭。如果你不願意，就不要回複了。”隗囂知道劉秀看穿了他的詐術，於是就派使者向公孫述稱臣。
這時的匈奴與盧芳還不斷的侵擾邊境，劉秀就命令歸德侯劉颯前去出使匈奴，以修複以前的友好關係。但是單於態度傲慢，雖然有派使者回訪，但侵擾的暴行依舊不改。
到了公元31年的春季三月，劉秀就下令撤銷了郡國的輕車、騎士、材官等兵種，讓他們回去務農。
隗囂向公孫述稱臣後就被立為了朔寧王，公孫述還派兵來到隗囂這兒，為他提供軍事上的援助。
本月又發生了日食。
隨後，劉秀就下詔讓百官各自上書言事，上書的人不得稱頌聖明，太中大夫鄭興上疏說：“要是國家沒有好的政策，那就會受到上天的譴責，具體表現就是日食月食。而應對這種災禍的關鍵就在於能夠順應人心，選拔合適的人擔任合適的職位。如今的公卿大夫大多推舉漁陽太守郭汲可以擔任大司空，但是朝廷卻遲遲不做決定；這時民間就有了謠言，都說‘陛下想用功臣’，如果任用功臣的話，那麼官員的位置就會錯亂。希望陛下委屈自己，順從眾人的心意，以促成群臣推舉賢能人才的功勞。近年來日食大多發生在晦日，現在提前出現，都是因為月亮運行過快。太陽象征著君主，月亮象征著臣子；要是君主行事過於急躁，臣子就會感到壓力，所以月亮才會運行過快。如今陛下英明而群臣惶恐不安，所以陛下應當留心於柔和的政治，多關注《洪範》中的法則。”因為劉秀勤於政事，但過於嚴厲急躁，所以鄭興的上書中提到了這一點。
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夏季四月，朝廷下詔大赦天下。
五月，朝廷就任命前將軍李通為大司空。
這時大司農江馮上書說：“臣覺得應當命令司隸校尉督察三公。”司空掾陳元則是上疏說：“臣聽說以臣子為老師的是帝王，以臣子為賓客的是霸主。所以周武王以太公為老師，齊桓公以管仲為仲父，近世則有漢高祖優待相國的禮儀，漢文帝賦予宰相重權的事情。到了新朝王莽時期，漢朝遭遇了中衰，他獨攬國家大權，最終竊取了漢朝的天下，甚至還自我吹噓，不信任群臣，又剝奪了三公的職責，降低了宰相的權威，以檢舉揭發為明察，以攻擊他人為正直，以至於發生了奴仆告發主人，子弟背叛父兄的事情；法網嚴密，法令嚴酷，導致大臣們無所適從；然而即便如此，王莽仍然未能禁止董忠的謀反，最終自己也被世人所誅殺。如今四方尚未安定，天下還未統一，百姓都在觀望，耳朵和眼睛都非常的敏銳。陛下應當修習文王、武王的聖典，繼承祖宗遺留的美德，用心結交下麵的有識之士，屈身對待賢能的人，實在不應該讓有關部門來督察三公的名聲。”劉秀最終采納了他的建議。
這時的酒泉太守竺曾因為弟弟報仇殺人的事，就主動辭去了太守職務；竇融秉承朝廷的旨意，任命竺曾為武鋒將軍，又改任辛肜為酒泉太守。
到了秋季，隗囂就率領三萬步騎兵侵犯安定，他的大軍到達陰盤時，馮異就率領眾將抵抗；隗囂又命令別將下隴山，在汧縣攻打祭遵。結果隗囂的軍隊沒能取得勝利，就隻好先撤退了。這時的劉秀準備親自征討隗囂，就先通知了竇融出兵的日期，恰好遇到了大雨天，導致道路斷絕，而且隗囂的軍隊已經撤退了，於是就放棄了這個想法。隨後，劉秀就命令來歙寫信招降王遵，結果王遵前來投降，最後被任命為太中大夫，封為了向義侯。
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